More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3019 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
434 aa  858    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
434 aa  858    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  44.21 
 
 
454 aa  317  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  38.59 
 
 
437 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  38.97 
 
 
448 aa  257  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  37.32 
 
 
434 aa  246  6.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  29.77 
 
 
1833 aa  218  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  33.41 
 
 
438 aa  206  7e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  30.23 
 
 
445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 
432 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 
432 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  29.41 
 
 
1816 aa  195  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 
463 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  30.31 
 
 
433 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  31.3 
 
 
449 aa  179  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6160  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 
438 aa  177  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  32.6 
 
 
425 aa  176  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  30.95 
 
 
449 aa  176  8e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  32.32 
 
 
495 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  29.04 
 
 
1829 aa  170  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3334  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.13 
 
 
1776 aa  170  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311515  normal  0.562431 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  28.7 
 
 
439 aa  169  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  29.1 
 
 
2720 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.76 
 
 
1864 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  28.81 
 
 
1876 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  29.17 
 
 
414 aa  163  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.09 
 
 
1806 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  27.32 
 
 
441 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1086  major facilitator superfamily protein  57.46 
 
 
134 aa  153  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 
499 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  26.45 
 
 
1839 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 
432 aa  140  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 
415 aa  140  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  27.4 
 
 
432 aa  136  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 
406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  29.89 
 
 
425 aa  133  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  24.94 
 
 
448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  29.84 
 
 
1769 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  27.82 
 
 
397 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  28.61 
 
 
430 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  25.07 
 
 
411 aa  121  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 
440 aa  120  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0024  macrolide-efflux protein  27 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0413389 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 
439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1575  major facilitator transporter  26.97 
 
 
472 aa  112  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1647  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  25.87 
 
 
927 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0697  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  25.87 
 
 
927 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  28.75 
 
 
425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0616  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  25.87 
 
 
927 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1732  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  25.87 
 
 
927 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1937  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  25.87 
 
 
927 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2296  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  25.87 
 
 
927 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200957  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2215  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  25.87 
 
 
927 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.360269  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 
458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  24.66 
 
 
394 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05460  macrolide-efflux transmembrane protein  26.02 
 
 
450 aa  107  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.810092  normal  0.114702 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 
439 aa  104  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 
423 aa  97.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  27.39 
 
 
474 aa  97.1  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1968  major facilitator transporter  29.56 
 
 
461 aa  96.7  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 
412 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  23.84 
 
 
432 aa  93.2  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  24.9 
 
 
410 aa  90.1  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 
420 aa  89.7  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  27.12 
 
 
418 aa  89.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 
433 aa  89.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  27.84 
 
 
414 aa  88.2  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  22.86 
 
 
444 aa  87  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  27.47 
 
 
414 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  23.89 
 
 
405 aa  86.7  8e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  27.11 
 
 
417 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  24.93 
 
 
418 aa  85.1  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  28.21 
 
 
410 aa  84.7  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  25 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 
419 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 
407 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0658  permease of the major facilitator superfamily  22.89 
 
 
485 aa  82.4  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.590518  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1259  major facilitator superfamily MFS_1  24.51 
 
 
445 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.385793 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  25.4 
 
 
412 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  23.85 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  27.44 
 
 
420 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 
461 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  25.94 
 
 
403 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  23.26 
 
 
440 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  23.54 
 
 
422 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  24.6 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  23.84 
 
 
450 aa  78.6  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 
433 aa  79  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  22.73 
 
 
422 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  23.87 
 
 
422 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  23.02 
 
 
422 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  24.9 
 
 
423 aa  76.6  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 
408 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 
433 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 
429 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  23.53 
 
 
422 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  22.64 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  24.84 
 
 
422 aa  74.7  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  25.68 
 
 
414 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  23.34 
 
 
422 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>