More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2654 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  100 
 
 		 414 aa  815    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  49.18 
 
 		 439 aa  417  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  35.2 
 
 		 434 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 438 aa  250  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  33.33 
 
 		 1816 aa  249  6e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 463 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  32.55 
 
 		 1833 aa  232  9e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 449 aa  223  7e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 445 aa  219  5e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  32 
 
 		 449 aa  219  8.999999999999998e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 		 432 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 		 432 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  31.63 
 
 		 499 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  29.34 
 
 		 1829 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 454 aa  203  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  31.05 
 
 		 495 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.25 
 
 		 1876 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  28.61 
 
 		 2720 aa  190  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  30.89 
 
 		 1769 aa  186  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  30.75 
 
 		 441 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  29.6 
 
 		 448 aa  184  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6160  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 		 438 aa  182  9.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.17 
 
 		 1839 aa  176  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 432 aa  172  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.54 
 
 		 1806 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 437 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3334  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  26.71 
 
 		 1776 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311515  normal  0.562431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  24.71 
 
 		 1864 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 432 aa  150  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  27.29 
 
 		 425 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 425 aa  132  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 415 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  25.99 
 
 		 422 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 414 aa  123  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  24.73 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 430 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.2 
 
 		 422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  29.83 
 
 		 415 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05510  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 446 aa  120  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354906  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  25.65 
 
 		 422 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  24.47 
 
 		 422 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  25.65 
 
 		 422 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 425 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 412 aa  119  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  24.2 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.2 
 
 		 422 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  28.01 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  25.2 
 
 		 422 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  29.5 
 
 		 414 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  27.03 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  27.3 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 422 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  27.03 
 
 		 417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  25 
 
 		 434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  33.64 
 
 		 417 aa  114  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  24.73 
 
 		 434 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  33.64 
 
 		 415 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  24.73 
 
 		 434 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1575  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 472 aa  113  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  27.2 
 
 		 405 aa  113  7.000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  25.12 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1732  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  25.51 
 
 		 927 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1647  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  25.51 
 
 		 927 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1937  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  25.51 
 
 		 927 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0616  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  25.51 
 
 		 927 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2215  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  25.51 
 
 		 927 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.360269  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2296  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  25.51 
 
 		 927 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  25.13 
 
 		 410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0697  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  25.51 
 
 		 927 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  24.46 
 
 		 434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  24.8 
 
 		 434 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1968  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 461 aa  110  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  24.46 
 
 		 432 aa  110  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 413 aa  110  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 413 aa  110  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  24.18 
 
 		 434 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  24.46 
 
 		 431 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  24.12 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 439 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 		 433 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 458 aa  103  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 440 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 420 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  25.25 
 
 		 412 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1259  major facilitator superfamily MFS_1  23.25 
 
 		 445 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.385793 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0658  permease of the major facilitator superfamily  24.07 
 
 		 485 aa  97.4  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.590518  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 412 aa  96.7  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>