More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1011 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
458 aa  894    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  57.93 
 
 
432 aa  428  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  60.76 
 
 
439 aa  415  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
440 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  42.05 
 
 
415 aa  306  7e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  40.11 
 
 
406 aa  294  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  40.31 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0024  macrolide-efflux protein  39.49 
 
 
397 aa  269  7e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0413389 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0658  permease of the major facilitator superfamily  36.54 
 
 
485 aa  241  2e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.590518  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 
412 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  34.57 
 
 
411 aa  172  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  29.95 
 
 
405 aa  160  3e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  29.35 
 
 
425 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 
407 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05460  macrolide-efflux transmembrane protein  31.52 
 
 
450 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.810092  normal  0.114702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  30.17 
 
 
425 aa  139  8.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 
439 aa  136  8e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  30.18 
 
 
394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  32.03 
 
 
430 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  28.21 
 
 
438 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0969  major facilitator superfamily permease  26.29 
 
 
410 aa  122  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00309098  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  25 
 
 
448 aa  121  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  28.02 
 
 
425 aa  120  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  24.52 
 
 
1833 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  30.29 
 
 
434 aa  117  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  29.72 
 
 
411 aa  117  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 
463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  25.98 
 
 
422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  26.29 
 
 
439 aa  113  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 
432 aa  113  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  30.42 
 
 
1816 aa  113  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 
434 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 
434 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  24.42 
 
 
422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 
448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  26.65 
 
 
414 aa  108  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  25.19 
 
 
422 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.62 
 
 
1876 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  27.27 
 
 
454 aa  106  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 
499 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  29.13 
 
 
1864 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6160  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 
438 aa  103  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  24.28 
 
 
422 aa  103  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  24.61 
 
 
422 aa  103  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  25.26 
 
 
422 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  24.8 
 
 
422 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 
445 aa  100  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.48 
 
 
422 aa  99.8  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  22.69 
 
 
405 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  23.87 
 
 
418 aa  99  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  24.74 
 
 
422 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.74 
 
 
422 aa  99  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  24.74 
 
 
422 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  26.92 
 
 
445 aa  98.6  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  26.5 
 
 
1829 aa  96.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  30.58 
 
 
449 aa  96.7  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  27.05 
 
 
413 aa  95.5  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  27.05 
 
 
413 aa  95.5  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  29.89 
 
 
495 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  29.44 
 
 
449 aa  94.4  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 
444 aa  94  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  28.64 
 
 
1806 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  22.31 
 
 
441 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 
437 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 
433 aa  88.2  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  25.96 
 
 
1769 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.2 
 
 
1839 aa  83.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 
403 aa  83.6  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.31 
 
 
390 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 
442 aa  82  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.31 
 
 
390 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1603  putative permease  23.57 
 
 
421 aa  80.9  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  24.21 
 
 
410 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 
397 aa  79.3  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05510  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 
446 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354906  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
417 aa  78.2  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 
440 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  26.65 
 
 
414 aa  77.8  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 
432 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 
432 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  25.2 
 
 
436 aa  77  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 
461 aa  75.1  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  22.93 
 
 
423 aa  74.7  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 
429 aa  74.7  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  29.05 
 
 
415 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  26.02 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  22.95 
 
 
450 aa  74.3  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  25.33 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  25.38 
 
 
446 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 
424 aa  73.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2733  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 
424 aa  73.9  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3650  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 
426 aa  73.6  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0850  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.427056  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0063  major facilitator superfamily protein  27.09 
 
 
419 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.586585  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0367  sugar transporter  23.33 
 
 
410 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000621781  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1575  major facilitator transporter  23.68 
 
 
472 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 
425 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  22.22 
 
 
427 aa  72.4  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 
449 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>