More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2187 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  100 
 
 		 495 aa  956    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  54.2 
 
 		 449 aa  422  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  55.53 
 
 		 449 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  40.84 
 
 		 434 aa  318  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 438 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  37 
 
 		 1816 aa  294  3e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  34.19 
 
 		 1833 aa  290  4e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  37.9 
 
 		 499 aa  282  8.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 445 aa  281  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 463 aa  273  6e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6160  major facilitator superfamily MFS_1  40.86 
 
 		 438 aa  253  8.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  37.15 
 
 		 432 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  37.15 
 
 		 432 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 439 aa  245  9.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  37.07 
 
 		 1876 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  35.13 
 
 		 1829 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  29.18 
 
 		 448 aa  229  9e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 454 aa  217  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  32.03 
 
 		 414 aa  215  9.999999999999999e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  34.33 
 
 		 1864 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  37.96 
 
 		 1806 aa  213  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 		 434 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 		 434 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  33.18 
 
 		 1839 aa  206  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  33 
 
 		 432 aa  203  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  35.67 
 
 		 448 aa  200  6e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  32.72 
 
 		 2720 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  33.42 
 
 		 1769 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  28.21 
 
 		 441 aa  186  9e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3334  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  33.72 
 
 		 1776 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311515  normal  0.562431 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 		 437 aa  173  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 433 aa  158  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0697  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  31.12 
 
 		 927 aa  150  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2296  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  31.12 
 
 		 927 aa  150  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200957  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1647  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  31.12 
 
 		 927 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1732  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  31.12 
 
 		 927 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1937  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  31.12 
 
 		 927 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0616  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  31.12 
 
 		 927 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2215  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  31.12 
 
 		 927 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.360269  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 430 aa  134  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  24.6 
 
 		 406 aa  121  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1575  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 472 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05460  macrolide-efflux transmembrane protein  34.64 
 
 		 450 aa  110  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.810092  normal  0.114702 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  25.4 
 
 		 397 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0024  macrolide-efflux protein  25.14 
 
 		 397 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0413389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 474 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 439 aa  103  8e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1086  major facilitator superfamily protein  33.83 
 
 		 134 aa  100  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  30.05 
 
 		 394 aa  100  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 425 aa  99.8  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  29.04 
 
 		 411 aa  99.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  24.61 
 
 		 422 aa  99.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 439 aa  98.2  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 458 aa  97.8  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1968  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 461 aa  97.8  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 425 aa  97.8  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 432 aa  97.4  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  26.12 
 
 		 405 aa  96.7  9e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 420 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 390 aa  94.7  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 390 aa  94.7  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  22.81 
 
 		 422 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  27.65 
 
 		 446 aa  92  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 429 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1259  major facilitator superfamily MFS_1  23.61 
 
 		 445 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.385793 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  22.43 
 
 		 422 aa  92.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  25.94 
 
 		 408 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 428 aa  91.3  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  27.06 
 
 		 408 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 453 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  22.15 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 440 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  29.87 
 
 		 411 aa  89  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 		 426 aa  88.2  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0293  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 413 aa  88.2  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 419 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 420 aa  86.7  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0240  transporter, putative  23.28 
 
 		 393 aa  86.3  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 431 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  22.81 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  24.28 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  22.4 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  22.81 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  28.23 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  22.81 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 428 aa  84  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  26.53 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  27.82 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1603  putative permease  30.71 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  22.28 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  27.82 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  22.55 
 
 		 422 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  24.32 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  27.82 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  23.81 
 
 		 422 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>