More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05460 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05460  macrolide-efflux transmembrane protein  100 
 
 		 450 aa  869    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.810092  normal  0.114702 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  68.51 
 
 		 411 aa  495  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  62.07 
 
 		 425 aa  478  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  64.71 
 
 		 394 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 425 aa  353  4e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  37.22 
 
 		 425 aa  230  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  34.61 
 
 		 439 aa  186  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  31.02 
 
 		 405 aa  166  8e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  30.37 
 
 		 397 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0024  macrolide-efflux protein  30.61 
 
 		 397 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0413389 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 432 aa  164  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 440 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 406 aa  162  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  30.37 
 
 		 411 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 412 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 445 aa  149  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 		 458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 407 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 463 aa  146  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  33.33 
 
 		 1816 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  26.01 
 
 		 1833 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0969  major facilitator superfamily permease  26.36 
 
 		 410 aa  126  6e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00309098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0658  permease of the major facilitator superfamily  26.07 
 
 		 485 aa  124  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.590518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  32.55 
 
 		 1839 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  32.39 
 
 		 1769 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  24.61 
 
 		 448 aa  121  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  32.47 
 
 		 1829 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 439 aa  117  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 434 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 434 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.11 
 
 		 1876 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 474 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  27.88 
 
 		 441 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  25.26 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 432 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  29.37 
 
 		 2720 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  27.46 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  31.84 
 
 		 495 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 419 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.66 
 
 		 1864 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 432 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  28.09 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 437 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  28.61 
 
 		 1806 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 441 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1575  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 472 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 413 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  25.76 
 
 		 422 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 422 aa  97.8  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 449 aa  97.8  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 448 aa  96.7  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  23.83 
 
 		 409 aa  96.3  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6160  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 438 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 446 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  25.97 
 
 		 446 aa  94.4  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1086  major facilitator superfamily protein  34.4 
 
 		 134 aa  94  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  26.5 
 
 		 404 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3334  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  29.68 
 
 		 1776 aa  93.6  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311515  normal  0.562431 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  26.02 
 
 		 406 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 		 432 aa  93.2  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 423 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 474 aa  92.4  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  26.16 
 
 		 422 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  25.25 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 418 aa  92.4  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  26 
 
 		 406 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  25.75 
 
 		 422 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  25.13 
 
 		 414 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 427 aa  90.9  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 450 aa  90.9  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 408 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  27 
 
 		 422 aa  90.5  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  22.63 
 
 		 422 aa  90.1  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 440 aa  89.7  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  25.41 
 
 		 422 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  25.41 
 
 		 422 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  25 
 
 		 406 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 		 442 aa  89  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  25.14 
 
 		 422 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 432 aa  88.6  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.73 
 
 		 406 aa  87.8  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 447 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  24.38 
 
 		 362 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  24.81 
 
 		 406 aa  87.8  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  21.91 
 
 		 413 aa  87.4  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  21.91 
 
 		 413 aa  87.4  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>