More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5814 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 423 aa  853    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  42.01 
 
 		 413 aa  323  4e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  40.24 
 
 		 447 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  39.06 
 
 		 446 aa  317  4e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  42.04 
 
 		 409 aa  313  4.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  39.95 
 
 		 424 aa  306  7e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  40.89 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  40.29 
 
 		 440 aa  296  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  42.05 
 
 		 414 aa  296  4e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  40.44 
 
 		 441 aa  292  9e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  37.86 
 
 		 432 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  36.52 
 
 		 474 aa  273  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  37.37 
 
 		 412 aa  251  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  37.01 
 
 		 474 aa  251  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 		 418 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  38.11 
 
 		 413 aa  247  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  38 
 
 		 421 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  36.52 
 
 		 408 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 418 aa  239  8e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  35.79 
 
 		 412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  33.85 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 407 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  33.74 
 
 		 431 aa  229  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  36.7 
 
 		 414 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 413 aa  229  8e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  34.67 
 
 		 418 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 		 410 aa  225  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  35.91 
 
 		 414 aa  222  9e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 		 435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 		 433 aa  220  3e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  33.25 
 
 		 430 aa  219  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  33.59 
 
 		 423 aa  216  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 		 421 aa  216  7e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 450 aa  213  7e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 436 aa  212  9e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  31.3 
 
 		 403 aa  210  3e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  32.23 
 
 		 435 aa  209  7e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 418 aa  208  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 426 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.6 
 
 		 446 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 405 aa  206  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  32.75 
 
 		 446 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1011  major facilitator superfamily MFS_1  36.45 
 
 		 414 aa  206  9e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1008  major facilitator superfamily MFS_1  36.45 
 
 		 414 aa  206  9e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 442 aa  204  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  29.74 
 
 		 410 aa  203  5e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 417 aa  202  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  31.89 
 
 		 431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  30.62 
 
 		 426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 		 431 aa  199  7e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  31.09 
 
 		 412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  36.57 
 
 		 378 aa  197  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 410 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5797  hypothetical protein  30.73 
 
 		 419 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  32.42 
 
 		 441 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  34.24 
 
 		 418 aa  196  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 		 402 aa  195  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 442 aa  195  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 457 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 413 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 416 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  30.94 
 
 		 414 aa  193  5e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 406 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 		 419 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 420 aa  190  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  31.35 
 
 		 413 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 436 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 461 aa  186  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  31.88 
 
 		 405 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 416 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 429 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  33.5 
 
 		 429 aa  182  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  30 
 
 		 412 aa  180  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 		 417 aa  179  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 403 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 424 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 419 aa  177  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 441 aa  176  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 		 417 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 494 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 450 aa  173  5e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  29.26 
 
 		 452 aa  173  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 453 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 428 aa  170  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 450 aa  169  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 491 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 		 432 aa  168  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  31.66 
 
 		 425 aa  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  31.73 
 
 		 424 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 425 aa  166  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 415 aa  164  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>