More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5813 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  87.67 
 
 		 446 aa  793    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  80.05 
 
 		 441 aa  683    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 446 aa  887    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  69.95 
 
 		 419 aa  551  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  72.49 
 
 		 428 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  67 
 
 		 413 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  66.58 
 
 		 416 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  66.75 
 
 		 413 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  67 
 
 		 413 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  67.76 
 
 		 412 aa  521  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  66.42 
 
 		 404 aa  523  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  65.89 
 
 		 405 aa  518  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  66.06 
 
 		 402 aa  519  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  66.76 
 
 		 416 aa  504  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  64.66 
 
 		 418 aa  500  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  53.27 
 
 		 456 aa  423  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  52.36 
 
 		 450 aa  424  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  56.08 
 
 		 450 aa  421  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  47.42 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  51.16 
 
 		 452 aa  404  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  51.49 
 
 		 412 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  48.87 
 
 		 406 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  52.23 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  51.43 
 
 		 457 aa  372  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  53.05 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  51.69 
 
 		 426 aa  365  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  50.75 
 
 		 461 aa  357  2.9999999999999997e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  47.91 
 
 		 432 aa  347  2e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  47.63 
 
 		 424 aa  345  7e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  46.17 
 
 		 420 aa  340  2.9999999999999998e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  50.27 
 
 		 418 aa  332  8e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  47.48 
 
 		 413 aa  331  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  46.27 
 
 		 414 aa  325  8.000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  46.72 
 
 		 403 aa  316  5e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  46.15 
 
 		 452 aa  316  6e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  47.07 
 
 		 424 aa  307  3e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  48.65 
 
 		 442 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  45.74 
 
 		 429 aa  301  2e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  47.62 
 
 		 476 aa  298  9e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  43.58 
 
 		 405 aa  297  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  43.62 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  39.6 
 
 		 425 aa  287  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  42.64 
 
 		 441 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  44.15 
 
 		 426 aa  286  5e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  40.69 
 
 		 431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  42.63 
 
 		 436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  43.4 
 
 		 450 aa  264  3e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 509 aa  263  6e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 		 453 aa  260  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  40.7 
 
 		 417 aa  259  7e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  41.84 
 
 		 435 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  43.49 
 
 		 412 aa  255  9e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  35.8 
 
 		 494 aa  254  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3670  major facilitator superfamily MFS_1  39.04 
 
 		 475 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  37.3 
 
 		 429 aa  233  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  34.65 
 
 		 430 aa  229  6e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  34.33 
 
 		 426 aa  226  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 474 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  38.82 
 
 		 431 aa  224  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  37.2 
 
 		 418 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  38.65 
 
 		 491 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 421 aa  212  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  34.75 
 
 		 410 aa  210  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 		 418 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  32.75 
 
 		 423 aa  206  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  36.14 
 
 		 446 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 412 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 		 433 aa  202  8e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  38.4 
 
 		 412 aa  202  9e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3120  major facilitator superfamily MFS_1  38.35 
 
 		 428 aa  199  7.999999999999999e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  31.76 
 
 		 403 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 447 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 440 aa  196  6e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 		 409 aa  196  9e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 428 aa  195  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  36.23 
 
 		 413 aa  195  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 474 aa  195  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 418 aa  193  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 		 415 aa  193  6e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  32.36 
 
 		 410 aa  191  2e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 441 aa  190  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 436 aa  190  5.999999999999999e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  34.05 
 
 		 440 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  35.41 
 
 		 442 aa  189  7e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  37.89 
 
 		 426 aa  186  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  32.85 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3320  major facilitator transporter  38.58 
 
 		 425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104451  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 421 aa  178  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 401 aa  176  8e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 413 aa  176  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  35.44 
 
 		 404 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 		 419 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  30.93 
 
 		 424 aa  172  9e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  35.16 
 
 		 414 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 432 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 413 aa  168  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  37.6 
 
 		 414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 		 378 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  31.02 
 
 		 429 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 413 aa  164  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>