More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0593 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  100 
 
 
413 aa  813    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  100 
 
 
413 aa  813    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  44.47 
 
 
418 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  37.59 
 
 
427 aa  280  4e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  38.46 
 
 
423 aa  277  3e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  31.7 
 
 
432 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 
433 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 
444 aa  186  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  28.75 
 
 
422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  28.5 
 
 
422 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  29.58 
 
 
422 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  29.24 
 
 
422 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  29.24 
 
 
422 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  29.06 
 
 
422 aa  169  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  29.24 
 
 
422 aa  169  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  28.5 
 
 
422 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  28.98 
 
 
422 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  28.98 
 
 
422 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  28.98 
 
 
422 aa  166  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  29.04 
 
 
434 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  29.04 
 
 
434 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  28.79 
 
 
434 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  29.22 
 
 
434 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  27.59 
 
 
434 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  28.8 
 
 
390 aa  158  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  28.8 
 
 
390 aa  158  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  28.36 
 
 
434 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  28.17 
 
 
410 aa  156  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  28.13 
 
 
432 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  28.13 
 
 
431 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05510  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 
446 aa  149  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  26.87 
 
 
417 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  26.85 
 
 
414 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  26.62 
 
 
415 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  26.35 
 
 
415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  26.87 
 
 
417 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  27.05 
 
 
412 aa  138  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  26.62 
 
 
417 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  26.62 
 
 
415 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  27.54 
 
 
414 aa  137  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  27.52 
 
 
414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  26.73 
 
 
412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  24.81 
 
 
412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 
406 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  29.27 
 
 
404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  29.27 
 
 
404 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  25.88 
 
 
420 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 
415 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1603  putative permease  28.22 
 
 
421 aa  123  5e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  27.52 
 
 
432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 
405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  28.5 
 
 
404 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  28.5 
 
 
404 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  25.92 
 
 
436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  28.05 
 
 
404 aa  117  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 
440 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 
440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  26.2 
 
 
427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  28.61 
 
 
446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  26.1 
 
 
403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 
463 aa  113  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  27.85 
 
 
420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  27.85 
 
 
420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  27.85 
 
 
420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 
442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  27.59 
 
 
420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  25.85 
 
 
414 aa  110  7.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  27.6 
 
 
404 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 
414 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  27.51 
 
 
405 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  27.51 
 
 
405 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  28.27 
 
 
420 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  26.04 
 
 
397 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  26.98 
 
 
412 aa  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  23.86 
 
 
1833 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  27.47 
 
 
420 aa  106  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  27.73 
 
 
420 aa  106  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 
408 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  26.18 
 
 
406 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  26.51 
 
 
435 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  26.98 
 
 
413 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  26.18 
 
 
406 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 
420 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 
440 aa  104  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 
406 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 
432 aa  103  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  23.65 
 
 
423 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  26.42 
 
 
474 aa  103  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  26.36 
 
 
1829 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  27.73 
 
 
420 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2064  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
411 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0419892  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 
433 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 
419 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  25.9 
 
 
406 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 
401 aa  101  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  25.19 
 
 
406 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  24.69 
 
 
406 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  25.94 
 
 
1876 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1443  ABC transporter, permease protein, putative  29.69 
 
 
296 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  27.6 
 
 
418 aa  100  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>