More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0476 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  100 
 
 
474 aa  935    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  55.61 
 
 
418 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  45.57 
 
 
418 aa  351  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  44.17 
 
 
412 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  45.79 
 
 
421 aa  318  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  43.44 
 
 
418 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  44.3 
 
 
474 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  47.32 
 
 
378 aa  298  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  42.03 
 
 
428 aa  294  3e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  39.73 
 
 
410 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  42.14 
 
 
413 aa  281  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  44.59 
 
 
412 aa  281  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  37.12 
 
 
433 aa  268  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  37.01 
 
 
423 aa  263  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  43.55 
 
 
441 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  37.1 
 
 
424 aa  260  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  38.18 
 
 
430 aa  260  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  39.2 
 
 
447 aa  259  8e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  41.92 
 
 
413 aa  256  5e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  41 
 
 
440 aa  256  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  39.8 
 
 
426 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  36.46 
 
 
410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  40.09 
 
 
461 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  39.6 
 
 
446 aa  254  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  38.52 
 
 
442 aa  254  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  40.62 
 
 
413 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  37.38 
 
 
436 aa  250  5e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  44.07 
 
 
415 aa  249  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  41.6 
 
 
442 aa  248  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  40.41 
 
 
424 aa  246  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 
440 aa  246  6e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  38.86 
 
 
426 aa  246  9e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  37.41 
 
 
435 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  40.22 
 
 
431 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  37.21 
 
 
417 aa  242  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  45.63 
 
 
404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  43.32 
 
 
418 aa  240  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  36.25 
 
 
432 aa  240  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  41.67 
 
 
426 aa  239  5.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  40.53 
 
 
431 aa  239  1e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  40.52 
 
 
450 aa  237  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 
419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  35.22 
 
 
409 aa  230  5e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  40.87 
 
 
421 aa  226  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 
414 aa  224  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  40.97 
 
 
403 aa  223  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  38.98 
 
 
417 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  38.82 
 
 
405 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  36.5 
 
 
401 aa  217  4e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  33.16 
 
 
403 aa  216  9e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  38.68 
 
 
413 aa  216  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 
441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 
450 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  31.78 
 
 
413 aa  214  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  37.17 
 
 
429 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  38.5 
 
 
413 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  38.5 
 
 
413 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  39.78 
 
 
491 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  38.72 
 
 
413 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  38.73 
 
 
408 aa  213  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 
453 aa  212  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  37.13 
 
 
436 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  35.71 
 
 
414 aa  211  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  36.25 
 
 
420 aa  211  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  37.6 
 
 
405 aa  210  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  38.34 
 
 
424 aa  209  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  39.35 
 
 
416 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  37.32 
 
 
428 aa  207  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 
417 aa  207  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  36.23 
 
 
456 aa  206  7e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  36.62 
 
 
452 aa  205  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 
402 aa  205  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  37.12 
 
 
476 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  39.59 
 
 
414 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  39.49 
 
 
412 aa  204  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 
446 aa  203  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  38.24 
 
 
416 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  35.87 
 
 
429 aa  201  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 
494 aa  200  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  34.72 
 
 
426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 
433 aa  199  9e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  39.11 
 
 
412 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  37.53 
 
 
446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  33.58 
 
 
410 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  35.09 
 
 
435 aa  197  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  37.53 
 
 
457 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  39.31 
 
 
452 aa  197  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  36.78 
 
 
431 aa  196  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  39.42 
 
 
414 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  37.4 
 
 
404 aa  195  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  33.42 
 
 
509 aa  195  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  38.36 
 
 
419 aa  193  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 
425 aa  193  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1389  major facilitator transporter  42.82 
 
 
431 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.627334  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  29.78 
 
 
431 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  34.18 
 
 
419 aa  190  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  34.62 
 
 
426 aa  190  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3542  major facilitator superfamily MFS_1  37.41 
 
 
405 aa  188  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00114528  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  35.68 
 
 
441 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  36.29 
 
 
441 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>