More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0872 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  100 
 
 		 405 aa  809    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  65.34 
 
 		 411 aa  518  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  39.59 
 
 		 412 aa  277  3e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  39.21 
 
 		 407 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 439 aa  238  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 425 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 406 aa  206  6e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 430 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 415 aa  193  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  32.05 
 
 		 394 aa  190  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 		 432 aa  189  8e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  33.07 
 
 		 397 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 		 439 aa  186  9e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0024  macrolide-efflux protein  32.64 
 
 		 397 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0413389 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  30 
 
 		 425 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  30.35 
 
 		 411 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 458 aa  168  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 425 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 440 aa  159  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0969  major facilitator superfamily permease  30.33 
 
 		 410 aa  159  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00309098  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05460  macrolide-efflux transmembrane protein  33.16 
 
 		 450 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.810092  normal  0.114702 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 439 aa  149  6e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 434 aa  142  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  30.24 
 
 		 441 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  27.59 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0658  permease of the major facilitator superfamily  28.07 
 
 		 485 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.590518  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 463 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 438 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  27.54 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 432 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 432 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 		 433 aa  115  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 437 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.37 
 
 		 1829 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 414 aa  112  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6160  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 		 438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  25.19 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  24.02 
 
 		 422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 422 aa  110  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  26.43 
 
 		 1769 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  24.94 
 
 		 434 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 423 aa  109  8.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  25.82 
 
 		 434 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  24.8 
 
 		 417 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  25.57 
 
 		 434 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 449 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  25.82 
 
 		 434 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  25.06 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  25.07 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  26.69 
 
 		 1839 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  24.8 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  22.16 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  25.84 
 
 		 431 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  25.63 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 499 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  24.6 
 
 		 422 aa  106  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.33 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  24.54 
 
 		 415 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  24.2 
 
 		 422 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  23.26 
 
 		 422 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  25.66 
 
 		 410 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  24.61 
 
 		 1864 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 432 aa  102  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  25.95 
 
 		 1816 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05510  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354906  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  24.6 
 
 		 422 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  24.28 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  24.74 
 
 		 432 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  23.67 
 
 		 422 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  24.6 
 
 		 422 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  24.28 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  24.73 
 
 		 1833 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  23.89 
 
 		 434 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  23.89 
 
 		 434 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  23.67 
 
 		 422 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  25.59 
 
 		 495 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  22.49 
 
 		 423 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  25.87 
 
 		 1876 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  23.53 
 
 		 414 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3334  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  24.32 
 
 		 1776 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311515  normal  0.562431 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  25.86 
 
 		 424 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 418 aa  97.4  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 		 429 aa  94  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 427 aa  91.3  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 397 aa  91.3  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 		 409 aa  90.1  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  22.64 
 
 		 433 aa  90.1  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  22.91 
 
 		 446 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  23.06 
 
 		 1806 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  22.44 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.53 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 432 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 448 aa  88.6  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>