Gene Haur_1250 details

Gene Information       Plasmid Coverage information       Fosmid Coverage information       Sequence       

Gene Information

Locus tagHaur_1250 
Symbol 
ID5733128 
TypeCDS 
Is gene splicedNo 
Is pseudo geneNo 
Organism nameHerpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 
KingdomBacteria 
Replicon accessionNC_009972 
Strand
Start bp1460318 
End bp1461595 
Gene Length1278 bp 
Protein Length425 aa 
Translation table11 
GC content50% 
IMG OID641278390 
Productmajor facilitator transporter 
Protein accessionYP_001544026 
Protein GI159897779 
COG category 
COG ID 
TIGRFAM ID 


Plasmid Coverage information

Num covering plasmid clones21 
Plasmid unclonability p-value
Plasmid hitchhikingNo 
Plasmid clonabilitynormal 
 

Fosmid Coverage information

Num covering fosmid clonesn/a 
Fosmid unclonability p-valuen/a 
Fosmid Hitchhikern/a 
Fosmid clonabilityn/a 
 

Sequence

Gene sequence
ATGCAAAATC CTTCTTCAAC GGCTTGGTTG GGTCGGTTTC TGAGTATTTG GCTGGGCCAA 
GTTTTCTCAT TAGTCGGAAG CCAATTAGTT CAATTTGCGA TTATTTGGAA TTTAACCCTG
CGCACTGGTT CGGCCACAAC CTTAGCTTTT GCCACATTAA TGGCGATGTT GCCAGCGGTG
TTGCTTTCAC CGTTTATCGG CACTTGGGTT GATCGCATGA ATCGCCAAGT GATTATGTTG
GTTGCTGATG CATGTTCGAT GTTGGTGACG ATTGGCTTGG CCTTGCTCTT TTGGCGTGGG
GCTGATGCAG TGTGGCATAT TTACGCGGCG TTGTTATTAC GTTCGATTTG TGAGCGATTC
CATGCCACAG CTATGGGTGC TTCGACTGTG TTACTTGTGC CCAAAACCCA TTTGGCCCGG
GTTCAAGGCC TCAACCAAGC CTTGAATGGC GGTATGAATA TTGTTGCCGC GCCACTGGGC
GCATGGCTGA TTGCCAAATT TCCCTTGCAA GTTGTTTTAT CAATTGATGT AGTTACAGCC
TTGTTGGCAA TTTTGCCCTT GCTTTTTGTG CGTATTCCCC AGCCACAGCG TGATGCCGAC
CGCAAAGTTA CCTTTTGGCA AGATATGCGC GAAGGTTTTA ACTATGTAAT TGGCTGGCGT
GGCTTGTTGA TAAGCTTGAT TATGGTGAGC ATGATCAATT TGGTGATGAC TCCGATTGGC
TCATTGTTGC CTTTGCTCGT GACCAAAATT TTTGGTGGCG GAGCCAGCGA ATTGGGCTGG
ATGGAAGCTG CGCTCTCGAT TGGGATTATC CTCGGCGGGG TTTTGCTGAG CGTTTGGGGC
GGCTTCAAGC GGCGGATTGT TACAGCCTTG TTTGGCTTGG TGCTGCTGGG CAGTTTCACC
TTGTTGATGG GAATCATGCC TAGTTCATTG ATTTGGGCCG CGATTGCCAT GAACGGTTTG
GTTGGCCTGA GTTTGCCAAT CGTTAATGGC TCGTTTGGGG CGATGATTCA AGGTGTGATT
GCGCCCGAAT TGCAAGGGCG GGTATTCTCG TTGGTTGCCA GCTTTGCCAC GGCCATGGCT
CCATTGGGCC TCTTATTAGC TGGCCCGATT GCTGATAGTT TTGGTCTGCG GGTTTGGTAC
ATTCTTGGTG GTGTGGTGAC GATAGCAATG GGCGTGTTGG GGTTTGGTTT GCGCTCAGTT
ATGACTATGG AAAGCCAATC GCACGAGGCT GAACCACCAA TCGTCGAGGC AAGCCTAAGC
CAAGCCGAAG CGTTATAG
 
Protein sequence
MQNPSSTAWL GRFLSIWLGQ VFSLVGSQLV QFAIIWNLTL RTGSATTLAF ATLMAMLPAV 
LLSPFIGTWV DRMNRQVIML VADACSMLVT IGLALLFWRG ADAVWHIYAA LLLRSICERF
HATAMGASTV LLVPKTHLAR VQGLNQALNG GMNIVAAPLG AWLIAKFPLQ VVLSIDVVTA
LLAILPLLFV RIPQPQRDAD RKVTFWQDMR EGFNYVIGWR GLLISLIMVS MINLVMTPIG
SLLPLLVTKI FGGGASELGW MEAALSIGII LGGVLLSVWG GFKRRIVTAL FGLVLLGSFT
LLMGIMPSSL IWAAIAMNGL VGLSLPIVNG SFGAMIQGVI APELQGRVFS LVASFATAMA
PLGLLLAGPI ADSFGLRVWY ILGGVVTIAM GVLGFGLRSV MTMESQSHEA EPPIVEASLS
QAEAL