More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3179 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  100 
 
 
445 aa  890    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  48.02 
 
 
434 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  43.43 
 
 
438 aa  343  4e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  42.54 
 
 
1833 aa  322  8e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  38.26 
 
 
1816 aa  295  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  38.07 
 
 
463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  41.12 
 
 
432 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  41.12 
 
 
432 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  38.26 
 
 
499 aa  280  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  36.62 
 
 
1829 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  35.4 
 
 
449 aa  261  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  36.98 
 
 
449 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  34.28 
 
 
1864 aa  256  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  35.07 
 
 
495 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6160  major facilitator superfamily MFS_1  37.32 
 
 
438 aa  246  4.9999999999999997e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  35.83 
 
 
454 aa  246  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  37.79 
 
 
1806 aa  246  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  36.16 
 
 
1876 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  32.79 
 
 
1839 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  34.32 
 
 
432 aa  219  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  29.1 
 
 
448 aa  218  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  35.51 
 
 
1769 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  32.01 
 
 
439 aa  216  5.9999999999999996e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  32.89 
 
 
414 aa  214  3.9999999999999995e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3334  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  35.88 
 
 
1776 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311515  normal  0.562431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.7 
 
 
2720 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 
437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 
434 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 
434 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  27.51 
 
 
441 aa  195  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 
448 aa  192  8e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 
433 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  34.25 
 
 
425 aa  157  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  30.84 
 
 
425 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  27.89 
 
 
430 aa  139  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1647  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  27.19 
 
 
927 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0616  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  27.19 
 
 
927 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1937  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  27.19 
 
 
927 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1732  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  27.19 
 
 
927 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2296  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  27.19 
 
 
927 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200957  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2215  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  27.19 
 
 
927 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.360269  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0697  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  27.19 
 
 
927 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  28.37 
 
 
394 aa  132  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  29.54 
 
 
425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  27.44 
 
 
411 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05460  macrolide-efflux transmembrane protein  29.98 
 
 
450 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.810092  normal  0.114702 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 
439 aa  120  4.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1259  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 
445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.385793 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  28.32 
 
 
390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  28.32 
 
 
390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 
407 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1575  major facilitator transporter  25.83 
 
 
472 aa  113  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 
439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 
406 aa  110  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 
412 aa  110  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  28.9 
 
 
404 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  29.64 
 
 
422 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  29.64 
 
 
422 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  26.26 
 
 
405 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  26.26 
 
 
405 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  28.37 
 
 
422 aa  107  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  28.32 
 
 
406 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  29.36 
 
 
422 aa  106  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1968  major facilitator transporter  29.43 
 
 
461 aa  106  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  28.53 
 
 
422 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  29.09 
 
 
422 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  26.94 
 
 
422 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  26.51 
 
 
422 aa  103  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1086  major facilitator superfamily protein  35.82 
 
 
134 aa  103  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  27.75 
 
 
406 aa  103  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  28.81 
 
 
422 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  26.78 
 
 
406 aa  103  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  28.97 
 
 
422 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  27.75 
 
 
406 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  27.75 
 
 
406 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  28.21 
 
 
422 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 
432 aa  100  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  27.46 
 
 
406 aa  100  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  30.84 
 
 
417 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 
426 aa  99.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  30.84 
 
 
417 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  30.84 
 
 
415 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  30.84 
 
 
415 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  23.22 
 
 
474 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  30.84 
 
 
417 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  29.91 
 
 
414 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 
419 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  30.37 
 
 
415 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  26.1 
 
 
424 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  31.97 
 
 
420 aa  97.1  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 
440 aa  97.1  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  31.97 
 
 
420 aa  97.1  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  31.06 
 
 
420 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  31.61 
 
 
420 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  33.73 
 
 
450 aa  96.3  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  26.8 
 
 
418 aa  95.9  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  27.45 
 
 
411 aa  95.9  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  31.97 
 
 
420 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 
408 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>