More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1968 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1968  major facilitator transporter  100 
 
 		 461 aa  898    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1575  major facilitator transporter  38.22 
 
 		 472 aa  294  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  26.88 
 
 		 414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 463 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 454 aa  130  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 445 aa  126  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  29.33 
 
 		 1816 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  25.88 
 
 		 1833 aa  123  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6160  major facilitator superfamily MFS_1  32.4 
 
 		 438 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 		 448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 499 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 438 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  28.54 
 
 		 1876 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 425 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.54 
 
 		 2720 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 		 439 aa  101  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.4 
 
 		 1839 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  29.59 
 
 		 495 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 		 437 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  27.69 
 
 		 1769 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 432 aa  97.4  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  28.41 
 
 		 411 aa  94.7  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 		 407 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.46 
 
 		 1829 aa  89.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  25.35 
 
 		 411 aa  87  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  21.93 
 
 		 412 aa  86.7  9e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 		 430 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3334  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  28.78 
 
 		 1776 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311515  normal  0.562431 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  23.54 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 444 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  25.93 
 
 		 1864 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  25.63 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 418 aa  82.8  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  23.84 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  22.47 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  28.82 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  22.64 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  21.46 
 
 		 412 aa  79.7  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  21.95 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 440 aa  79  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  21.7 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  21.7 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  21.94 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  22.01 
 
 		 448 aa  77.4  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0240  transporter, putative  23.83 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  22.44 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  22.44 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  21.45 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_003296  RS05460  macrolide-efflux transmembrane protein  26.53 
 
 		 450 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.810092  normal  0.114702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  23.1 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  22.5 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  23.1 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  22.19 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 451 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0029  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  21.64 
 
 		 431 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  23.44 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  21.2 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  21.2 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  25.57 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  28.68 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  20.96 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  22.49 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  23.64 
 
 		 428 aa  69.7  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  23.01 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  26.89 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  23.01 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  28.06 
 
 		 662 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  23.56 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  26.48 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  22.49 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2589  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 482 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0568188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3528  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 482 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  21.85 
 
 		 410 aa  67  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 		 429 aa  67  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  23.97 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>