More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2540 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 430 aa  826    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  53.85 
 
 		 420 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  43.87 
 
 		 417 aa  302  7.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  46.83 
 
 		 414 aa  293  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  45.87 
 
 		 416 aa  273  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  41.4 
 
 		 439 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 		 441 aa  238  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  38.96 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  38.61 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  36.38 
 
 		 439 aa  215  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  39.51 
 
 		 414 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  42.3 
 
 		 420 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  37.71 
 
 		 432 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  38.22 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  34.95 
 
 		 431 aa  200  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  36.47 
 
 		 423 aa  199  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  35.05 
 
 		 444 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  35.52 
 
 		 450 aa  193  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 435 aa  192  9e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 		 412 aa  182  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 426 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  36.65 
 
 		 461 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 		 420 aa  173  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  27.48 
 
 		 414 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  27.48 
 
 		 414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  26.97 
 
 		 417 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  34.28 
 
 		 405 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 432 aa  153  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  34.63 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 		 433 aa  139  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 427 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 		 411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 		 429 aa  126  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 441 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  31.73 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  31.64 
 
 		 415 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  31.64 
 
 		 415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  31.62 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6800  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 		 437 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 426 aa  116  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  31.93 
 
 		 378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  31.93 
 
 		 378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  31.93 
 
 		 378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  23.1 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 434 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0482  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  0.855857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  29.2 
 
 		 408 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  31.8 
 
 		 406 aa  107  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 416 aa  106  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2477  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 415 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 451 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 442 aa  99.8  8e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  26.4 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 418 aa  98.2  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 436 aa  97.4  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 420 aa  97.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 420 aa  97.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  28.72 
 
 		 411 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  23.87 
 
 		 413 aa  92  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  23.87 
 
 		 413 aa  92  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  29.97 
 
 		 424 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 418 aa  91.3  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4238  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 420 aa  89.7  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375023 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  24.94 
 
 		 419 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 		 440 aa  88.2  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  23.36 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0240  transporter, putative  26.11 
 
 		 393 aa  87.8  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 408 aa  87.8  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 435 aa  87  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  22.74 
 
 		 408 aa  86.7  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  23.41 
 
 		 433 aa  86.7  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  25.23 
 
 		 419 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 463 aa  86.3  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 		 428 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 429 aa  86.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  24.83 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  30 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  24.83 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  24.71 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  22.54 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  24.71 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4322  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369395  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  22.62 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  22.62 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>