More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4322 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4322  major facilitator transporter  100 
 
 		 418 aa  806    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369395  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 417 aa  209  8e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  35.24 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  35 
 
 		 427 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1744  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 		 436 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5360  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 430 aa  106  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.261806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  24.37 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  24.37 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 408 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 430 aa  99.8  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4665  hypothetical protein  28.68 
 
 		 445 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0402536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 		 420 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 432 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8128  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 512 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  30.37 
 
 		 417 aa  91.7  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 441 aa  90.9  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24170  arabinose efflux permease family protein  29.17 
 
 		 405 aa  86.7  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.917707  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  27.63 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  27.37 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  27.11 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  27.11 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7174  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 		 428 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  27.75 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  25.94 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1663  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  34.1 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  27.49 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  24.81 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  27.23 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 431 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  27.09 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  25.44 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  25.44 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  24.19 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  25.07 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  24.22 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  24.75 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  24.43 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  23.88 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  23.88 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  23.88 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  23.88 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  28.88 
 
 		 424 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  24.06 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  28.88 
 
 		 424 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  23.88 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  24.19 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  23.64 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 		 414 aa  67  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  27.65 
 
 		 431 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 451 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  25.22 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  31.6 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  24.45 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3253  protein of unknown function DUF894, DitE  31.71 
 
 		 533 aa  64.7  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373  normal  0.254586 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.02 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  27.43 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 439 aa  63.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  29.39 
 
 		 444 aa  63.2  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  23.68 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0110  multidrug ABC transporter permease  28.57 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  28.64 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0736  protein of unknown function DUF894, DitE  26.39 
 
 		 539 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>