More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4282 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 420 aa  806    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 420 aa  806    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  59.41 
 
 		 408 aa  388  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 417 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  49.76 
 
 		 415 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  49.52 
 
 		 415 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  49.52 
 
 		 415 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  50.25 
 
 		 406 aa  300  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  49.48 
 
 		 378 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  49.48 
 
 		 378 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  49.48 
 
 		 378 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1403  transporter, putative  60.14 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.726678  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  30.25 
 
 		 417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 431 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 		 432 aa  112  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 		 408 aa  109  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 450 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 435 aa  107  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 428 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 426 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 423 aa  103  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 415 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 408 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 430 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 		 442 aa  97.8  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 		 411 aa  96.7  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 425 aa  96.3  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 421 aa  95.9  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 412 aa  93.6  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 420 aa  93.2  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 426 aa  93.2  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 405 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 427 aa  90.5  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 420 aa  90.5  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  23.43 
 
 		 405 aa  90.1  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  23.43 
 
 		 405 aa  90.1  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 451 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 436 aa  89.7  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  28.21 
 
 		 414 aa  89.7  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  32.34 
 
 		 418 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 		 429 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  32.34 
 
 		 418 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 432 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  32.34 
 
 		 418 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  32.34 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  32.34 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  32.07 
 
 		 397 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 439 aa  87  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  30.4 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  24.01 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  24.01 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  30.05 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 413 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 413 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 413 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  21.16 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  33.47 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  21.13 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  28.8 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  31.09 
 
 		 530 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  32.36 
 
 		 418 aa  76.6  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 421 aa  76.3  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  20.9 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  25 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  32.27 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  29.63 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  29.63 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  29.67 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  29.37 
 
 		 535 aa  73.2  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  24.25 
 
 		 434 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  24.63 
 
 		 434 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  23.23 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 432 aa  73.2  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  24.63 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 439 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  24.63 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.22 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  24.25 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2025  protein of unknown function DUF894, DitE  30.08 
 
 		 554 aa  71.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>