More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6250 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 433 aa  843    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  62.02 
 
 		 436 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  55.22 
 
 		 405 aa  391  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  39.86 
 
 		 420 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  37.31 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  35.65 
 
 		 430 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 414 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  37.03 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  35.75 
 
 		 423 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  36.19 
 
 		 444 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 435 aa  189  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  37.36 
 
 		 416 aa  189  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  36.58 
 
 		 431 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 408 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  37.97 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 		 417 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  34.92 
 
 		 412 aa  176  9e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 		 450 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 		 441 aa  164  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 439 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 		 439 aa  160  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  26.24 
 
 		 417 aa  159  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 		 414 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  26.49 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  26.38 
 
 		 414 aa  153  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 		 417 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 405 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 405 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  33.42 
 
 		 415 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  33.16 
 
 		 415 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 		 411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  33.33 
 
 		 378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  33.33 
 
 		 378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  33.33 
 
 		 378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 451 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  33.16 
 
 		 415 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 435 aa  123  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 402 aa  123  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 		 406 aa  112  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  25.66 
 
 		 408 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  25.66 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 432 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  25.59 
 
 		 408 aa  106  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  25.85 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  25.42 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  25.42 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  25.65 
 
 		 408 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  30.03 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 421 aa  102  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4916  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 		 423 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00150833  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2477  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 415 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 426 aa  99  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 434 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 		 408 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  28.72 
 
 		 408 aa  94  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 433 aa  92.8  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 441 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7174  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 		 401 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  23 
 
 		 410 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 429 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 431 aa  89.7  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6800  major facilitator superfamily MFS_1  30.82 
 
 		 437 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 420 aa  88.2  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 420 aa  88.2  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4238  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 420 aa  87  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375023 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 413 aa  86.7  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 413 aa  86.7  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 		 467 aa  85.5  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  27.01 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  27.25 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4989  hypothetical protein  30.03 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  26.51 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 440 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  25.29 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 456 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  27.49 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 499 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.85 
 
 		 1829 aa  81.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>