More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4138 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
435 aa  855    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4528  major facilitator superfamily MFS_1  41.1 
 
 
409 aa  249  7e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.392098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 
410 aa  217  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  34.27 
 
 
417 aa  208  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  37.01 
 
 
432 aa  196  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0062  putative membrane transport protein  36.29 
 
 
418 aa  192  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640827  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  33.76 
 
 
415 aa  180  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0062  major facilitator superfamily protein  34.97 
 
 
431 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 
429 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 
442 aa  166  9e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0534  hypothetical protein  33.33 
 
 
412 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0805  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 
459 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 
433 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5551  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 
420 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4585  putative membrane transport protein  33.25 
 
 
403 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00668253  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 
442 aa  134  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  27.27 
 
 
436 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  30.4 
 
 
446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 
440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1062  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 
423 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.264864  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  29.02 
 
 
429 aa  121  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  31.27 
 
 
420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  31.06 
 
 
447 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  27.6 
 
 
420 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  28.53 
 
 
424 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  28.53 
 
 
424 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  27.41 
 
 
420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  27.41 
 
 
420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 
432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  27.41 
 
 
420 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  27.41 
 
 
420 aa  117  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  28.65 
 
 
420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  30.56 
 
 
443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 
409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  27.69 
 
 
431 aa  114  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  28.12 
 
 
420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  28.32 
 
 
424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0092  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
414 aa  110  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.031642  normal  0.214383 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 
428 aa  110  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  29.74 
 
 
426 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 
419 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0310  major facilitator transporter  27.79 
 
 
443 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  28.95 
 
 
441 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4617  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
455 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117227  hitchhiker  0.000601374 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  27.23 
 
 
420 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  21.49 
 
 
1833 aa  106  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  24.27 
 
 
430 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  24.37 
 
 
412 aa  103  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  27.11 
 
 
417 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  34.17 
 
 
450 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  27.37 
 
 
414 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 
453 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  27.76 
 
 
474 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 
423 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  29.97 
 
 
418 aa  99.8  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  26.84 
 
 
414 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 
408 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  28.46 
 
 
418 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 
440 aa  98.2  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 
412 aa  97.4  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 
415 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 
431 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2819  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 
462 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000630163  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4887  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
424 aa  95.1  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 
430 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.18 
 
 
446 aa  93.6  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 
419 aa  93.2  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 
401 aa  92.4  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  30.08 
 
 
412 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 
422 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  29.65 
 
 
413 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  29.96 
 
 
428 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 
456 aa  92  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 
420 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  33.64 
 
 
435 aa  92.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  29.24 
 
 
431 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 
425 aa  91.3  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  28.07 
 
 
426 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 
418 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 
414 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0210  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 
476 aa  90.5  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  24.8 
 
 
414 aa  90.1  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  28.02 
 
 
415 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 
378 aa  89.7  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  30.21 
 
 
415 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 
418 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  24.67 
 
 
415 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 
405 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 
416 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 
402 aa  89.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  28.08 
 
 
416 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  24.73 
 
 
390 aa  88.6  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  33.17 
 
 
429 aa  88.6  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  28.02 
 
 
524 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  24.73 
 
 
390 aa  88.6  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 
412 aa  87.8  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  29.17 
 
 
415 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  29.17 
 
 
415 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  29.17 
 
 
415 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  26.6 
 
 
420 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>