More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1041 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  100 
 
 		 428 aa  808    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  60 
 
 		 431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 414 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 		 420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  34.43 
 
 		 417 aa  208  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  39.45 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  37.63 
 
 		 420 aa  187  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  34.74 
 
 		 415 aa  183  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 444 aa  170  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 		 423 aa  170  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  37.35 
 
 		 441 aa  167  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 413 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 		 433 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 436 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  34.87 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 		 417 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 461 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 420 aa  156  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 		 432 aa  152  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 412 aa  145  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 421 aa  144  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  25.12 
 
 		 414 aa  143  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  25.12 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  25.12 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 		 439 aa  142  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  34.24 
 
 		 439 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 435 aa  133  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 432 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  25.18 
 
 		 410 aa  123  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  32.07 
 
 		 408 aa  109  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 427 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 426 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  26.37 
 
 		 408 aa  106  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  27.3 
 
 		 408 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  25.69 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4238  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375023 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  26.49 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 420 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  29.43 
 
 		 411 aa  100  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  26.36 
 
 		 408 aa  99.8  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  26.36 
 
 		 408 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  26.36 
 
 		 408 aa  99.8  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 444 aa  99  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  30.25 
 
 		 415 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 		 429 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 417 aa  96.7  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 411 aa  96.3  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  30 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 416 aa  95.9  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 		 428 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  30 
 
 		 415 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6800  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 437 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 435 aa  93.2  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  30.08 
 
 		 378 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 416 aa  92.8  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  30.08 
 
 		 378 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  30.08 
 
 		 378 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2477  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 415 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 463 aa  91.3  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  26.18 
 
 		 420 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  25.93 
 
 		 420 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  25.33 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  26.44 
 
 		 420 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  28.46 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  24.91 
 
 		 434 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  26.82 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  26.82 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  24.91 
 
 		 434 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  25.92 
 
 		 420 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  24.91 
 
 		 434 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  25.09 
 
 		 434 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  26.63 
 
 		 420 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  25.46 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  24.4 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 432 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 433 aa  86.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  24.57 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 442 aa  85.1  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  29.77 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 		 433 aa  83.6  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 418 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>