124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6800 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6800  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 437 aa  838    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6955  hypothetical protein  59.24 
 
 		 430 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.123489  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2477  major facilitator transporter  52.97 
 
 		 415 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 		 416 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  32.05 
 
 		 417 aa  111  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 		 430 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 417 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 		 450 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 420 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 405 aa  94  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 405 aa  94  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 420 aa  92.8  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 		 432 aa  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 436 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21960  Major Facilitator Superfamily transporter  34.46 
 
 		 407 aa  87.8  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.847097 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 420 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 417 aa  87.4  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 461 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 444 aa  83.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 441 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  30.82 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 413 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 401 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2652  transmembrane efflux protein  42.45 
 
 		 168 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  20 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  27.22 
 
 		 686 aa  67  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  19.94 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  19.94 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  20.26 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  28.52 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  27 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  28.45 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  22.45 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  25.09 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  21.95 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 416 aa  59.7  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 420 aa  57  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 420 aa  57  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 426 aa  55.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  21.82 
 
 		 412 aa  55.1  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  22.67 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  18.56 
 
 		 434 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  28.93 
 
 		 431 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  23.02 
 
 		 421 aa  53.5  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 406 aa  53.5  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  19.66 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  19.66 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  25.29 
 
 		 709 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  24.91 
 
 		 688 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 417 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2486  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 415 aa  51.2  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.364713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  19.32 
 
 		 434 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3741  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 426 aa  50.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  21.55 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  21.55 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  18.98 
 
 		 434 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  22.99 
 
 		 730 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  37.5 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  26.18 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 		 461 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 419 aa  48.9  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  22.56 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  27.65 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  18.98 
 
 		 434 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4597  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 727 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 434 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  20.76 
 
 		 433 aa  47  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4322  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 418 aa  46.6  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369395  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 		 437 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  24.36 
 
 		 419 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 435 aa  46.6  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  22.43 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  22.79 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 442 aa  46.6  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 458 aa  46.6  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>