More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5398 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 401 aa  759    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  36.77 
 
 		 417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  36.06 
 
 		 420 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  33.85 
 
 		 430 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  36.73 
 
 		 414 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  39.79 
 
 		 416 aa  172  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  35.86 
 
 		 408 aa  166  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  32.44 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  34.95 
 
 		 435 aa  159  8e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 444 aa  156  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 413 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 		 415 aa  143  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  34.18 
 
 		 441 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 428 aa  131  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  34.27 
 
 		 420 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 431 aa  130  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 		 439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 420 aa  127  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 450 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  22.59 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  22.59 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 436 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 439 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 461 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6800  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 437 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 433 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 		 405 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  23.72 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  23.47 
 
 		 414 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  23.04 
 
 		 417 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 451 aa  96.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  31.28 
 
 		 418 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  31.28 
 
 		 418 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  31.28 
 
 		 418 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  31.28 
 
 		 417 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  31.28 
 
 		 417 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  31.28 
 
 		 397 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 397 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  30.31 
 
 		 411 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4238  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 420 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375023 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 413 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 417 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  25.43 
 
 		 408 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  25.43 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  25.72 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  25.22 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  25.22 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  24.86 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  30.36 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 426 aa  82.8  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  28.27 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 416 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  24.57 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2477  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 442 aa  78.6  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  33.21 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  21.93 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 435 aa  76.3  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  25.81 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  22.7 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  25.48 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  25.48 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  25.48 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  25.48 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  25.48 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  22.35 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  25.97 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  25.16 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 461 aa  72  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  27.84 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1443  ABC transporter, permease protein, putative  26.46 
 
 		 296 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 474 aa  72  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  27.84 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  27.8 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>