More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7428 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  100 
 
 		 406 aa  786    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  39.14 
 
 		 429 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  42.17 
 
 		 426 aa  222  7e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  41.6 
 
 		 435 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  36.83 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  36.86 
 
 		 411 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  36.75 
 
 		 411 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  37.29 
 
 		 416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  37.71 
 
 		 402 aa  183  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  34.85 
 
 		 451 aa  172  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  36.68 
 
 		 416 aa  169  7e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  34.36 
 
 		 418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  34.36 
 
 		 418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  34.36 
 
 		 418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  34.36 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  34.36 
 
 		 417 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  34.36 
 
 		 417 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  34.36 
 
 		 397 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  37.64 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  32.98 
 
 		 415 aa  139  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 421 aa  136  9e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 439 aa  133  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 		 420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  32.79 
 
 		 427 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  32.75 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 		 430 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  28.76 
 
 		 414 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 456 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 		 420 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 		 408 aa  123  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 		 420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  30.32 
 
 		 417 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  36 
 
 		 289 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 461 aa  119  9e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 		 442 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 439 aa  113  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5351  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 401 aa  113  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1968  major facilitator superfamily MFS_1  36.16 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000336752  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 		 441 aa  108  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  23.42 
 
 		 405 aa  106  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  23.42 
 
 		 405 aa  106  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 421 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 420 aa  100  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 425 aa  99.8  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  31.66 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  26.03 
 
 		 403 aa  99  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  26.21 
 
 		 410 aa  99  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  23.74 
 
 		 414 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 431 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 427 aa  96.3  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  23.23 
 
 		 414 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  22.98 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  25.88 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 440 aa  95.5  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 420 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 420 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 436 aa  94  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 417 aa  93.2  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 432 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  28.57 
 
 		 415 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 461 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 442 aa  91.7  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  28.08 
 
 		 415 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1339  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 429 aa  90.5  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 414 aa  90.1  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1155  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 399 aa  90.1  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.128986 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  29.41 
 
 		 415 aa  89.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 408 aa  89.7  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 401 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7174  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 428 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 436 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4989  hypothetical protein  28.75 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 418 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  28.18 
 
 		 418 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 451 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  28.29 
 
 		 378 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 444 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  28.29 
 
 		 378 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  28.29 
 
 		 378 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4238  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 420 aa  86.7  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375023 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 420 aa  86.7  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 435 aa  86.7  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  26.55 
 
 		 431 aa  86.7  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 		 453 aa  86.3  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1753  major facilitator superfamily MFS_1  21.01 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  31.04 
 
 		 526 aa  85.5  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>