More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7117 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
432 aa  835    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  62.59 
 
 
439 aa  428  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  37.81 
 
 
417 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 
430 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  37.65 
 
 
420 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  39.85 
 
 
414 aa  209  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  39.75 
 
 
416 aa  206  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 
414 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  35.32 
 
 
441 aa  178  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  33.65 
 
 
444 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 
423 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  33.67 
 
 
408 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  38.97 
 
 
420 aa  171  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  31.8 
 
 
415 aa  166  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 
433 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 
412 aa  157  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 
450 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  31.54 
 
 
436 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 
439 aa  151  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  29.27 
 
 
435 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 
417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  30.84 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  30.18 
 
 
431 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  33.92 
 
 
461 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 
432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  28.85 
 
 
428 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  29.49 
 
 
413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 
401 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  24.33 
 
 
405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  24.33 
 
 
405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
426 aa  117  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  32.46 
 
 
434 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  25.32 
 
 
414 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 
417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  24.94 
 
 
414 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  28.37 
 
 
408 aa  109  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  28.35 
 
 
378 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  28.35 
 
 
378 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  28.35 
 
 
378 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  27.68 
 
 
415 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  27.68 
 
 
415 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  24.46 
 
 
421 aa  109  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  24.43 
 
 
417 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  27.68 
 
 
415 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 
411 aa  108  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 
421 aa  101  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  28.69 
 
 
426 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4238  major facilitator transporter  30.87 
 
 
420 aa  99  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.375023 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 
461 aa  97.1  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  29.06 
 
 
418 aa  96.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  29.66 
 
 
402 aa  96.3  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  28.8 
 
 
417 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  28.8 
 
 
418 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  28.8 
 
 
418 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  28.8 
 
 
417 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  28.99 
 
 
435 aa  94.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  29.72 
 
 
397 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  25.98 
 
 
432 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  26.49 
 
 
413 aa  94  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 
432 aa  93.2  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 
420 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
433 aa  92.8  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  28.61 
 
 
427 aa  92  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  31.37 
 
 
420 aa  92.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  29.44 
 
 
397 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6800  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 
437 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  27.97 
 
 
416 aa  89.7  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  28.68 
 
 
411 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 
451 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  29.01 
 
 
414 aa  89  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 
433 aa  88.2  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  27.43 
 
 
416 aa  87.4  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 
406 aa  86.7  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 
429 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  26.82 
 
 
418 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4916  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 
423 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00150833  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 
420 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 
420 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2477  major facilitator transporter  27.83 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  27.53 
 
 
416 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 
418 aa  84.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  25.85 
 
 
416 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  24.33 
 
 
436 aa  83.6  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 
442 aa  83.2  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  28.1 
 
 
416 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  27.74 
 
 
431 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  27.45 
 
 
416 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  27.45 
 
 
416 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  27.27 
 
 
406 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  28.69 
 
 
414 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 
440 aa  80.9  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 
420 aa  80.9  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  24.27 
 
 
406 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  25.71 
 
 
413 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  24.2 
 
 
412 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 
429 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  24.2 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  23.28 
 
 
421 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  31.01 
 
 
425 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 
442 aa  77  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.469185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>