More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2429 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
418 aa  782    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  52.87 
 
 
418 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  52.87 
 
 
417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  52.87 
 
 
417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  52.63 
 
 
418 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  52.63 
 
 
418 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  53.15 
 
 
397 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  52.9 
 
 
397 aa  342  5e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  56.14 
 
 
427 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  46.54 
 
 
456 aa  318  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  38.15 
 
 
435 aa  210  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  38.69 
 
 
426 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  40.76 
 
 
411 aa  193  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  35.21 
 
 
432 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  33.94 
 
 
402 aa  149  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  37.28 
 
 
434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 
420 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  35.34 
 
 
411 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 
421 aa  140  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  32.84 
 
 
416 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  32.67 
 
 
415 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 
429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  32.2 
 
 
414 aa  130  6e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 
461 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 
439 aa  126  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 
432 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  35.8 
 
 
402 aa  123  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  32.36 
 
 
425 aa  123  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 
442 aa  123  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  31.06 
 
 
416 aa  122  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  30.95 
 
 
420 aa  121  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  35.04 
 
 
408 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  32.51 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 
451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  37.86 
 
 
289 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 
415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 
420 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 
430 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  30.35 
 
 
427 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5351  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 
401 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804378  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 
442 aa  103  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  31.79 
 
 
417 aa  102  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4989  hypothetical protein  28.62 
 
 
342 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 
417 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 
440 aa  102  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  29.51 
 
 
436 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  33.91 
 
 
420 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  33.91 
 
 
420 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  29.72 
 
 
408 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  30.11 
 
 
414 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 
420 aa  97.4  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  27.75 
 
 
431 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 
433 aa  96.3  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  32.94 
 
 
428 aa  94.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  31.9 
 
 
415 aa  92.8  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2884  hypothetical protein  30.29 
 
 
543 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  29.45 
 
 
413 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  29.4 
 
 
461 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  26.42 
 
 
412 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  32.35 
 
 
415 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  31.9 
 
 
415 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  33.12 
 
 
401 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  21.34 
 
 
405 aa  90.5  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  21.34 
 
 
405 aa  90.5  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 
441 aa  89.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  23.14 
 
 
413 aa  89.4  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  23.14 
 
 
413 aa  89.4  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 
444 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 
447 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 
412 aa  87.8  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  31.37 
 
 
378 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  31.37 
 
 
378 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  31.37 
 
 
378 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 
441 aa  87.8  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  26.86 
 
 
429 aa  87  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 
406 aa  87.4  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 
415 aa  87  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  30.84 
 
 
432 aa  86.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  26.94 
 
 
408 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 
453 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  29.12 
 
 
535 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  25.97 
 
 
408 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  25.97 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  24.21 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  23.03 
 
 
403 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 
417 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  24.21 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  28.91 
 
 
441 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 
410 aa  84.3  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  25.95 
 
 
420 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  29.1 
 
 
431 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  25.95 
 
 
420 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  30 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  25.91 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  25.65 
 
 
408 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  25.45 
 
 
408 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  25.45 
 
 
408 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  24.2 
 
 
414 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  27.84 
 
 
474 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>