More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3134 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 417 aa  796    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  65.1 
 
 		 415 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  64.6 
 
 		 415 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  64.85 
 
 		 415 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  64.92 
 
 		 378 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  64.92 
 
 		 378 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  64.92 
 
 		 378 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  57.49 
 
 		 408 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  57.04 
 
 		 406 aa  344  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  51.24 
 
 		 420 aa  343  4e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  51.24 
 
 		 420 aa  343  4e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1403  transporter, putative  66.44 
 
 		 148 aa  157  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.726678  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 435 aa  147  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 		 433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  29.65 
 
 		 417 aa  133  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 441 aa  126  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 439 aa  125  9e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 412 aa  121  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 450 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 430 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 		 444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 405 aa  113  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 405 aa  113  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 405 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  28.84 
 
 		 414 aa  110  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 415 aa  109  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 432 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 436 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 416 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  21.07 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 432 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 431 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  22.16 
 
 		 414 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  32.09 
 
 		 532 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 428 aa  103  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 		 442 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 420 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  21.64 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 414 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  33.24 
 
 		 535 aa  100  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 413 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 425 aa  99  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 416 aa  98.6  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 417 aa  98.2  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 420 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  34.04 
 
 		 435 aa  97.8  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 427 aa  96.7  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 461 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 451 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 426 aa  94.4  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 432 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  31.05 
 
 		 560 aa  94.4  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  31.15 
 
 		 418 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5315  putative major facilitator superfamily transporter  34.77 
 
 		 539 aa  92.8  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00425912  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  30.87 
 
 		 418 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  33.03 
 
 		 418 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  30.87 
 
 		 417 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1554  protein of unknown function DUF894 DitE  34.1 
 
 		 553 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  30.87 
 
 		 418 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  30.87 
 
 		 417 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  30.87 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  24.94 
 
 		 408 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  30.55 
 
 		 429 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1625  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 417 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.568704  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 411 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1272  protein of unknown function DUF894 DitE  29.43 
 
 		 551 aa  88.6  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.951526 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 416 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  24.81 
 
 		 408 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 432 aa  87.4  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 416 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  24.81 
 
 		 408 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 434 aa  86.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5468  protein of unknown function DUF894 DitE  33.81 
 
 		 535 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 461 aa  85.5  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  33.64 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 456 aa  82.8  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  22.47 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  24.2 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  24.2 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 494 aa  82.4  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 416 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  25 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  24.81 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 451 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>