More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0234 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
442 aa  852    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  64.73 
 
 
415 aa  519  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  59.23 
 
 
420 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  62.94 
 
 
408 aa  444  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  57.5 
 
 
425 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  52.61 
 
 
421 aa  388  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  52.93 
 
 
432 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  47.2 
 
 
414 aa  356  5e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  47.22 
 
 
432 aa  320  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  42.89 
 
 
402 aa  245  9e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1968  major facilitator superfamily MFS_1  40.7 
 
 
405 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000336752  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  37.5 
 
 
435 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  35.4 
 
 
411 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  36.68 
 
 
426 aa  154  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  34.78 
 
 
416 aa  152  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 
451 aa  149  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 
411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 
429 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  38.95 
 
 
402 aa  130  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 
467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  31.88 
 
 
416 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 
461 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 
410 aa  121  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  40.39 
 
 
289 aa  113  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 
444 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  33.71 
 
 
434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  22.16 
 
 
405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  22.16 
 
 
405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 
420 aa  111  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  30.02 
 
 
415 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  28.3 
 
 
456 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 
418 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  29.79 
 
 
415 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  30.5 
 
 
427 aa  106  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  29.79 
 
 
415 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  27.14 
 
 
431 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  30.79 
 
 
427 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  28.77 
 
 
418 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  28.77 
 
 
418 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  28.77 
 
 
418 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  28.77 
 
 
417 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  28.77 
 
 
417 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  28.77 
 
 
397 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  28.77 
 
 
397 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  32.13 
 
 
406 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 
420 aa  100  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 
439 aa  99.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  26.08 
 
 
436 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  31.05 
 
 
378 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  31.05 
 
 
378 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  31.05 
 
 
378 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 
417 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 
406 aa  97.4  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 
421 aa  96.3  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 
440 aa  94.7  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 
447 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  23.47 
 
 
430 aa  94  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  28.57 
 
 
417 aa  93.2  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  24.61 
 
 
408 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  25.07 
 
 
408 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 
433 aa  91.3  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 
442 aa  91.7  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 
397 aa  91.3  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5351  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 
401 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804378  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  24.93 
 
 
408 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 
420 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  22.66 
 
 
423 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  27.38 
 
 
427 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  24.67 
 
 
408 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 
420 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 
420 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 
415 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 
412 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  24.93 
 
 
408 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  24.93 
 
 
408 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  20.46 
 
 
427 aa  86.7  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  27.59 
 
 
403 aa  86.7  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  24.07 
 
 
390 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  24.07 
 
 
390 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  30.49 
 
 
408 aa  84.7  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  29.38 
 
 
426 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  24.62 
 
 
413 aa  84.3  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  24.67 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 
444 aa  84.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  27.44 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  24.62 
 
 
413 aa  84.3  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  30.14 
 
 
416 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 
440 aa  84  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 
461 aa  83.6  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  26.15 
 
 
433 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  23.81 
 
 
410 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 
426 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1536  major facilitator transporter  24.79 
 
 
406 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  29.9 
 
 
416 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 
432 aa  81.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 
432 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  26.78 
 
 
428 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  26.88 
 
 
451 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>