More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_1705 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  100 
 
 
418 aa  800    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  99.76 
 
 
418 aa  798    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  100 
 
 
418 aa  800    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  99.76 
 
 
417 aa  798    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  99.24 
 
 
397 aa  754    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  99.24 
 
 
397 aa  754    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  99.76 
 
 
417 aa  798    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  52.63 
 
 
418 aa  323  4e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  49.64 
 
 
427 aa  317  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  44.11 
 
 
456 aa  288  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  38.79 
 
 
435 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  39.78 
 
 
411 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  38.79 
 
 
426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  34.04 
 
 
406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  35.58 
 
 
434 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  28.8 
 
 
432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  34.21 
 
 
411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  34.39 
 
 
467 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 
421 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 
420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  30.33 
 
 
415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  31.78 
 
 
402 aa  126  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  30.05 
 
 
420 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 
429 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  28.57 
 
 
414 aa  120  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  30.18 
 
 
425 aa  120  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  31.15 
 
 
416 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 
461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  29.58 
 
 
416 aa  113  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  32.85 
 
 
402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 
408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 
432 aa  109  9.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 
439 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 
451 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
442 aa  105  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 
420 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  33.61 
 
 
408 aa  97.8  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 
417 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 
415 aa  96.3  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4989  hypothetical protein  28.4 
 
 
342 aa  94.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  29.13 
 
 
417 aa  93.6  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 
420 aa  93.6  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 
420 aa  93.6  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  31.8 
 
 
289 aa  93.6  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 
441 aa  93.2  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  29.83 
 
 
413 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  29.95 
 
 
414 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 
420 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  22.54 
 
 
405 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  22.54 
 
 
405 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  30.92 
 
 
408 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  28.09 
 
 
461 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 
401 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  28.74 
 
 
427 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  29.27 
 
 
436 aa  83.2  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  24.08 
 
 
410 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
410 aa  83.2  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 
447 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  25.73 
 
 
420 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  25.73 
 
 
420 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  28.75 
 
 
426 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 
412 aa  79.7  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  25.73 
 
 
420 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  25.73 
 
 
420 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
440 aa  80.1  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 
426 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  28.93 
 
 
526 aa  78.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 
432 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 
442 aa  77.8  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  21.34 
 
 
406 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 
439 aa  77.4  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 
428 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 
433 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  26.97 
 
 
416 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  21.09 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  27 
 
 
431 aa  76.6  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  25.73 
 
 
420 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5351  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 
401 aa  76.6  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804378  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  28.64 
 
 
414 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
433 aa  76.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  28.07 
 
 
428 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  21.87 
 
 
413 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  21.87 
 
 
413 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  25.79 
 
 
420 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  21.09 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 
444 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  27.99 
 
 
416 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  28.16 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  28.16 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  25.15 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  28.12 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  22.58 
 
 
417 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  22.69 
 
 
414 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  26.13 
 
 
474 aa  73.2  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  27.94 
 
 
416 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  28.54 
 
 
413 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  21.09 
 
 
406 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  22.19 
 
 
414 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 
416 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  21.09 
 
 
406 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>