More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1272 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1272  protein of unknown function DUF894 DitE  100 
 
 
551 aa  1068    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.951526 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5468  protein of unknown function DUF894 DitE  69.9 
 
 
535 aa  686    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  70.25 
 
 
535 aa  717    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1554  protein of unknown function DUF894 DitE  66.86 
 
 
553 aa  664    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  66.36 
 
 
560 aa  678    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  67.88 
 
 
532 aa  701    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5315  putative major facilitator superfamily transporter  64.39 
 
 
539 aa  618  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00425912  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  49.81 
 
 
526 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  48.2 
 
 
549 aa  434  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2884  hypothetical protein  48.43 
 
 
543 aa  428  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  43.24 
 
 
532 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  43.36 
 
 
553 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29210  putative MFS transporter  44.38 
 
 
529 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5161  protein of unknown function DUF894, DitE  42.67 
 
 
532 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0839068 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2389  protein of unknown function DUF894 DitE  50 
 
 
549 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3978  transmembrane transport protein  43.49 
 
 
528 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2332  protein of unknown function DUF894 DitE  44.57 
 
 
549 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0975452  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2665  protein of unknown function DUF894, DitE  42.04 
 
 
542 aa  381  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0627895  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42320  major facilitator transpoter  43.21 
 
 
535 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.956299  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0189  hypothetical protein  47.21 
 
 
539 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1578  MFS family transporter  45.47 
 
 
529 aa  358  9.999999999999999e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0176553  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0311  transporter, putative  39.89 
 
 
542 aa  351  2e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.054545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0287  putative transporter  39.69 
 
 
542 aa  348  1e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  39.62 
 
 
586 aa  343  5e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  41.51 
 
 
530 aa  341  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  39 
 
 
541 aa  339  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3361  protein of unknown function DUF894 DitE  39.5 
 
 
542 aa  335  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0736  protein of unknown function DUF894, DitE  40.23 
 
 
539 aa  327  5e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  37.93 
 
 
542 aa  323  7e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2303  protein of unknown function DUF894 DitE  38.48 
 
 
536 aa  319  7e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0637  protein of unknown function DUF894, DitE  39.32 
 
 
536 aa  317  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167725  normal  0.197731 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3437  protein of unknown function DUF894 DitE  38.25 
 
 
551 aa  313  6.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545505  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4414  protein of unknown function DUF894, DitE  39.88 
 
 
557 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.91404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1167  protein of unknown function DUF894, DitE  40.81 
 
 
529 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4012  protein of unknown function DUF894, DitE  39.51 
 
 
569 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0803  protein of unknown function DUF894, DitE  38.62 
 
 
544 aa  303  6.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288414  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3362  protein of unknown function DUF894 DitE  39.51 
 
 
569 aa  303  7.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19310  hypothetical protein  36.41 
 
 
571 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1662  hypothetical protein  36.41 
 
 
572 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5125  protein of unknown function DUF894 DitE  40.47 
 
 
542 aa  300  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4092  protein of unknown function DUF894, DitE  40.12 
 
 
519 aa  300  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146023  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0118  hypothetical protein  37.5 
 
 
562 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3144  MFS family transporter  39.16 
 
 
541 aa  295  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.631195  normal  0.502456 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2969  protein of unknown function DUF894, DitE  40.56 
 
 
561 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.207712 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0215  protein of unknown function DUF894, DitE  39.36 
 
 
533 aa  293  6e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.155573  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4649  protein of unknown function DUF894, DitE  39.81 
 
 
574 aa  293  6e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0225  protein of unknown function DUF894, DitE  38.98 
 
 
533 aa  292  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.383838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0235  protein of unknown function DUF894, DitE  38.98 
 
 
533 aa  292  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2604  protein of unknown function DUF894, DitE  40.78 
 
 
541 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0685  protein of unknown function DUF894, DitE  36.19 
 
 
562 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.667795 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0945  major facilitator transporter  40.39 
 
 
541 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0009  protein of unknown function DUF894, DitE  38 
 
 
527 aa  284  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4071  protein of unknown function DUF894 DitE  37.19 
 
 
543 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0448  protein of unknown function DUF894, DitE  34.29 
 
 
555 aa  274  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2025  protein of unknown function DUF894, DitE  34.07 
 
 
554 aa  273  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0278  major facilitator superfamily permease  36.65 
 
 
560 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0090  protein of unknown function DUF894 DitE  35.69 
 
 
562 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4167  protein of unknown function DUF894, DitE  36.19 
 
 
532 aa  261  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3253  protein of unknown function DUF894, DitE  37.31 
 
 
533 aa  260  5.0000000000000005e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373  normal  0.254586 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  37.7 
 
 
419 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2666  MFS permease  36.34 
 
 
433 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2578  major facilitator family transporter  36.34 
 
 
433 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.909928  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1414  hypothetical protein  36.1 
 
 
433 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322764  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3174  hypothetical protein  36.1 
 
 
433 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.932461  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2139  hypothetical protein  36.1 
 
 
433 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1637  hypothetical protein  36.1 
 
 
429 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558918  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2524  major facilitator family transporter  36.1 
 
 
433 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  38.48 
 
 
409 aa  196  7e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1954  hypothetical protein  34.68 
 
 
433 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  34.86 
 
 
453 aa  169  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  34.48 
 
 
474 aa  164  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 
450 aa  157  4e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  31.19 
 
 
424 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  35.14 
 
 
450 aa  155  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  29.02 
 
 
474 aa  154  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 
461 aa  151  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  30.35 
 
 
447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 
440 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
441 aa  147  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
442 aa  147  6e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 
442 aa  144  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  28.64 
 
 
418 aa  144  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 
419 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  32.63 
 
 
452 aa  143  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  31.3 
 
 
418 aa  142  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 
424 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  32.23 
 
 
413 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  26.01 
 
 
436 aa  141  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  32.35 
 
 
446 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  31.86 
 
 
414 aa  139  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 
415 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 
417 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  34.15 
 
 
405 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 
423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 
433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 
456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  31.9 
 
 
457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 
418 aa  134  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  31.89 
 
 
412 aa  133  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
476 aa  131  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>