More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0842 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  100 
 
 
586 aa  1176    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0736  protein of unknown function DUF894, DitE  68.6 
 
 
539 aa  697    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3362  protein of unknown function DUF894 DitE  69.47 
 
 
569 aa  675    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4649  protein of unknown function DUF894, DitE  68.44 
 
 
574 aa  697    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0637  protein of unknown function DUF894, DitE  66.28 
 
 
536 aa  664    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167725  normal  0.197731 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4012  protein of unknown function DUF894, DitE  69.47 
 
 
569 aa  676    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4092  protein of unknown function DUF894, DitE  72.92 
 
 
519 aa  715    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146023  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5125  protein of unknown function DUF894 DitE  63.13 
 
 
542 aa  617  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2303  protein of unknown function DUF894 DitE  55.9 
 
 
536 aa  545  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  43.08 
 
 
532 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  41.63 
 
 
526 aa  346  7e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  41.09 
 
 
549 aa  342  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  37.27 
 
 
553 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  37.05 
 
 
532 aa  339  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1578  MFS family transporter  45.56 
 
 
529 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0176553  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5161  protein of unknown function DUF894, DitE  42.69 
 
 
532 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0839068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3978  transmembrane transport protein  42.42 
 
 
528 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29210  putative MFS transporter  42.34 
 
 
529 aa  337  5e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  39.27 
 
 
560 aa  332  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42320  major facilitator transpoter  41.76 
 
 
535 aa  329  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.956299  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5315  putative major facilitator superfamily transporter  38.91 
 
 
539 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00425912  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2884  hypothetical protein  41.15 
 
 
543 aa  325  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2665  protein of unknown function DUF894, DitE  42.57 
 
 
542 aa  323  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0627895  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1554  protein of unknown function DUF894 DitE  37.08 
 
 
553 aa  323  6e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1272  protein of unknown function DUF894 DitE  39.61 
 
 
551 aa  322  8e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.951526 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  37.38 
 
 
535 aa  322  9.000000000000001e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  36.8 
 
 
541 aa  310  5e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5468  protein of unknown function DUF894 DitE  38.08 
 
 
535 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2332  protein of unknown function DUF894 DitE  38.61 
 
 
549 aa  297  3e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0975452  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  34.23 
 
 
542 aa  295  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0118  hypothetical protein  36.21 
 
 
562 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4414  protein of unknown function DUF894, DitE  38 
 
 
557 aa  292  9e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.91404 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  37.81 
 
 
530 aa  291  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1167  protein of unknown function DUF894, DitE  38.4 
 
 
529 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3437  protein of unknown function DUF894 DitE  35.19 
 
 
551 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545505  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2389  protein of unknown function DUF894 DitE  37.73 
 
 
549 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0685  protein of unknown function DUF894, DitE  35.05 
 
 
562 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.667795 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0189  hypothetical protein  37.08 
 
 
539 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0311  transporter, putative  34.04 
 
 
542 aa  274  3e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.054545  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3361  protein of unknown function DUF894 DitE  34.92 
 
 
542 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0287  putative transporter  33.85 
 
 
542 aa  271  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4071  protein of unknown function DUF894 DitE  34.04 
 
 
543 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0090  protein of unknown function DUF894 DitE  35.97 
 
 
562 aa  260  6e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3144  MFS family transporter  35.47 
 
 
541 aa  257  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.631195  normal  0.502456 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0803  protein of unknown function DUF894, DitE  36.17 
 
 
544 aa  256  8e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288414  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2604  protein of unknown function DUF894, DitE  37.69 
 
 
541 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19310  hypothetical protein  31.2 
 
 
571 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1662  hypothetical protein  31.2 
 
 
572 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0945  major facilitator transporter  37.31 
 
 
541 aa  251  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2969  protein of unknown function DUF894, DitE  37.69 
 
 
561 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.207712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0225  protein of unknown function DUF894, DitE  36.36 
 
 
533 aa  250  5e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.383838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0235  protein of unknown function DUF894, DitE  36.36 
 
 
533 aa  250  5e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0215  protein of unknown function DUF894, DitE  36.56 
 
 
533 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.155573  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0278  major facilitator superfamily permease  34.22 
 
 
560 aa  249  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2025  protein of unknown function DUF894, DitE  33.14 
 
 
554 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0448  protein of unknown function DUF894, DitE  32.03 
 
 
555 aa  242  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0009  protein of unknown function DUF894, DitE  32.7 
 
 
527 aa  242  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4167  protein of unknown function DUF894, DitE  32.57 
 
 
532 aa  232  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3253  protein of unknown function DUF894, DitE  34.3 
 
 
533 aa  218  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373  normal  0.254586 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  34.84 
 
 
419 aa  188  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  36.78 
 
 
409 aa  172  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1954  hypothetical protein  35.79 
 
 
433 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1414  hypothetical protein  35 
 
 
433 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322764  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1637  hypothetical protein  35 
 
 
429 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558918  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2139  hypothetical protein  35 
 
 
433 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3174  hypothetical protein  35 
 
 
433 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.932461  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2524  major facilitator family transporter  35 
 
 
433 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2666  MFS permease  34.82 
 
 
433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2578  major facilitator family transporter  34.82 
 
 
433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.909928  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  30.98 
 
 
418 aa  145  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 
453 aa  144  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  30.29 
 
 
447 aa  143  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  31.9 
 
 
450 aa  143  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 
433 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  29.74 
 
 
407 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 
442 aa  141  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  29.93 
 
 
446 aa  136  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 
442 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 
441 aa  134  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  25.43 
 
 
403 aa  134  6.999999999999999e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 
440 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  26.55 
 
 
429 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  27.72 
 
 
426 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 
412 aa  130  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  28.13 
 
 
436 aa  130  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 
417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
419 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 
461 aa  127  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 
424 aa  127  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  30.2 
 
 
413 aa  126  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 
456 aa  126  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  27.36 
 
 
431 aa  125  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  28.05 
 
 
430 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 
431 aa  124  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  25.39 
 
 
410 aa  124  4e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  25.4 
 
 
424 aa  124  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  29.27 
 
 
426 aa  124  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  24.88 
 
 
412 aa  124  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 
431 aa  123  8e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  29.87 
 
 
413 aa  123  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>