More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0448 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0448  protein of unknown function DUF894, DitE  100 
 
 		 555 aa  1098    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0118  hypothetical protein  55.11 
 
 		 562 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0685  protein of unknown function DUF894, DitE  54.36 
 
 		 562 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.667795 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0090  protein of unknown function DUF894 DitE  55.49 
 
 		 562 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0278  major facilitator superfamily permease  55.87 
 
 		 560 aa  519  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2025  protein of unknown function DUF894, DitE  45.77 
 
 		 554 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  43.63 
 
 		 541 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4414  protein of unknown function DUF894, DitE  46.53 
 
 		 557 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.91404 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  43.19 
 
 		 542 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0311  transporter, putative  42.06 
 
 		 542 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.054545  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3437  protein of unknown function DUF894 DitE  43.43 
 
 		 551 aa  382  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0287  putative transporter  41.87 
 
 		 542 aa  376  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3361  protein of unknown function DUF894 DitE  41.31 
 
 		 542 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4071  protein of unknown function DUF894 DitE  43.69 
 
 		 543 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2969  protein of unknown function DUF894, DitE  44.3 
 
 		 561 aa  353  5e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.207712 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0945  major facilitator transporter  44.11 
 
 		 541 aa  347  4e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2604  protein of unknown function DUF894, DitE  43.93 
 
 		 541 aa  346  6e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0803  protein of unknown function DUF894, DitE  40.67 
 
 		 544 aa  344  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1662  hypothetical protein  35.47 
 
 		 572 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19310  hypothetical protein  35.28 
 
 		 571 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  37.64 
 
 		 526 aa  292  9e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2332  protein of unknown function DUF894 DitE  37.72 
 
 		 549 aa  282  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0975452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  35 
 
 		 553 aa  280  5e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2884  hypothetical protein  35.42 
 
 		 543 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1272  protein of unknown function DUF894 DitE  35.63 
 
 		 551 aa  274  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.951526 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29210  putative MFS transporter  37.5 
 
 		 529 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42320  major facilitator transpoter  37.76 
 
 		 535 aa  270  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.956299  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  41.02 
 
 		 419 aa  267  2.9999999999999995e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  33.46 
 
 		 535 aa  266  7e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  32.95 
 
 		 532 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  34.54 
 
 		 549 aa  264  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3253  protein of unknown function DUF894, DitE  38.03 
 
 		 533 aa  262  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373  normal  0.254586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3978  transmembrane transport protein  36.52 
 
 		 528 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  35.82 
 
 		 560 aa  261  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  32.25 
 
 		 532 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2389  protein of unknown function DUF894 DitE  35.32 
 
 		 549 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0189  hypothetical protein  33.85 
 
 		 539 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1554  protein of unknown function DUF894 DitE  35.89 
 
 		 553 aa  256  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2665  protein of unknown function DUF894, DitE  35.88 
 
 		 542 aa  256  9e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0627895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5161  protein of unknown function DUF894, DitE  32.95 
 
 		 532 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0839068 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0009  protein of unknown function DUF894, DitE  36.4 
 
 		 527 aa  253  9.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  31.96 
 
 		 586 aa  252  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1578  MFS family transporter  37.96 
 
 		 529 aa  249  1e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0176553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5315  putative major facilitator superfamily transporter  34.35 
 
 		 539 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00425912  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  41.67 
 
 		 409 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  35.02 
 
 		 530 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5468  protein of unknown function DUF894 DitE  34.19 
 
 		 535 aa  243  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4167  protein of unknown function DUF894, DitE  34.39 
 
 		 532 aa  241  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1167  protein of unknown function DUF894, DitE  34.36 
 
 		 529 aa  231  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3144  MFS family transporter  36.03 
 
 		 541 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.631195  normal  0.502456 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0215  protein of unknown function DUF894, DitE  33.33 
 
 		 533 aa  210  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.155573  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0225  protein of unknown function DUF894, DitE  33.86 
 
 		 533 aa  210  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.383838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0235  protein of unknown function DUF894, DitE  33.86 
 
 		 533 aa  210  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0736  protein of unknown function DUF894, DitE  31.38 
 
 		 539 aa  207  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1954  hypothetical protein  36.36 
 
 		 433 aa  204  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2524  major facilitator family transporter  37.41 
 
 		 433 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1637  hypothetical protein  37.9 
 
 		 429 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558918  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1414  hypothetical protein  37.9 
 
 		 433 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322764  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3174  hypothetical protein  37.9 
 
 		 433 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.932461  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2139  hypothetical protein  37.9 
 
 		 433 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0637  protein of unknown function DUF894, DitE  31.43 
 
 		 536 aa  203  8e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167725  normal  0.197731 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2666  MFS permease  37.16 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2578  major facilitator family transporter  37.16 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.909928  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5125  protein of unknown function DUF894 DitE  31.32 
 
 		 542 aa  198  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3362  protein of unknown function DUF894 DitE  30.67 
 
 		 569 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4012  protein of unknown function DUF894, DitE  30.67 
 
 		 569 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2303  protein of unknown function DUF894 DitE  30.74 
 
 		 536 aa  196  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4092  protein of unknown function DUF894, DitE  31.61 
 
 		 519 aa  190  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4649  protein of unknown function DUF894, DitE  30.17 
 
 		 574 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  27.27 
 
 		 410 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 421 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  32.72 
 
 		 418 aa  141  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 412 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 408 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 412 aa  133  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  30.58 
 
 		 431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 433 aa  131  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 442 aa  130  8.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 		 417 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 474 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 450 aa  126  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0297  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 		 423 aa  125  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0210722  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 418 aa  124  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 457 aa  124  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 405 aa  123  9e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  27.18 
 
 		 424 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  32.43 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  31.83 
 
 		 413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 441 aa  121  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 411 aa  120  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 413 aa  120  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 413 aa  120  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  31.06 
 
 		 412 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  26.55 
 
 		 430 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 415 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  28.91 
 
 		 429 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.59 
 
 		 446 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>