More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_19310 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1662  hypothetical protein  99.13 
 
 		 572 aa  1084    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19310  hypothetical protein  100 
 
 		 571 aa  1142    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  34.92 
 
 		 542 aa  347  4e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3437  protein of unknown function DUF894 DitE  37.9 
 
 		 551 aa  337  5e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545505  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0311  transporter, putative  37.85 
 
 		 542 aa  329  8e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.054545  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  38.34 
 
 		 526 aa  328  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0287  putative transporter  37.66 
 
 		 542 aa  327  5e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3361  protein of unknown function DUF894 DitE  37.31 
 
 		 542 aa  324  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  33.71 
 
 		 553 aa  319  7e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  34.58 
 
 		 541 aa  315  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4071  protein of unknown function DUF894 DitE  35.88 
 
 		 543 aa  307  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  36.28 
 
 		 532 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2884  hypothetical protein  35.71 
 
 		 543 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0448  protein of unknown function DUF894, DitE  35.66 
 
 		 555 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1272  protein of unknown function DUF894 DitE  36.62 
 
 		 551 aa  299  8e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.951526 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  34.78 
 
 		 535 aa  298  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  35.67 
 
 		 532 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4414  protein of unknown function DUF894, DitE  36.38 
 
 		 557 aa  297  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.91404 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5315  putative major facilitator superfamily transporter  37.45 
 
 		 539 aa  296  5e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00425912  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5161  protein of unknown function DUF894, DitE  36.66 
 
 		 532 aa  296  8e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0839068 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0685  protein of unknown function DUF894, DitE  32 
 
 		 562 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.667795 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  34.66 
 
 		 549 aa  288  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2332  protein of unknown function DUF894 DitE  35.75 
 
 		 549 aa  286  9e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0975452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  35.07 
 
 		 530 aa  280  4e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0278  major facilitator superfamily permease  35.21 
 
 		 560 aa  279  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0118  hypothetical protein  32.95 
 
 		 562 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0803  protein of unknown function DUF894, DitE  34.07 
 
 		 544 aa  278  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1167  protein of unknown function DUF894, DitE  35.38 
 
 		 529 aa  277  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0945  major facilitator transporter  37.95 
 
 		 541 aa  276  8e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0090  protein of unknown function DUF894 DitE  33.64 
 
 		 562 aa  276  8e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2604  protein of unknown function DUF894, DitE  37.26 
 
 		 541 aa  276  9e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2969  protein of unknown function DUF894, DitE  37.02 
 
 		 561 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.207712 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42320  major facilitator transpoter  36.07 
 
 		 535 aa  275  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.956299  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0189  hypothetical protein  33.21 
 
 		 539 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2665  protein of unknown function DUF894, DitE  35.32 
 
 		 542 aa  273  9e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0627895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29210  putative MFS transporter  35.59 
 
 		 529 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  34.92 
 
 		 560 aa  272  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1554  protein of unknown function DUF894 DitE  33.09 
 
 		 553 aa  271  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2025  protein of unknown function DUF894, DitE  33.02 
 
 		 554 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3978  transmembrane transport protein  35.4 
 
 		 528 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5468  protein of unknown function DUF894 DitE  35.17 
 
 		 535 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1578  MFS family transporter  36.1 
 
 		 529 aa  267  4e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0176553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  31.51 
 
 		 586 aa  266  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2389  protein of unknown function DUF894 DitE  32.59 
 
 		 549 aa  256  9e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0736  protein of unknown function DUF894, DitE  33.21 
 
 		 539 aa  250  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0009  protein of unknown function DUF894, DitE  31.19 
 
 		 527 aa  250  6e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3144  MFS family transporter  32.69 
 
 		 541 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.631195  normal  0.502456 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0215  protein of unknown function DUF894, DitE  33.21 
 
 		 533 aa  247  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.155573  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0637  protein of unknown function DUF894, DitE  31.8 
 
 		 536 aa  246  6e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167725  normal  0.197731 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0225  protein of unknown function DUF894, DitE  33.01 
 
 		 533 aa  246  9e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.383838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0235  protein of unknown function DUF894, DitE  33.01 
 
 		 533 aa  246  9e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3253  protein of unknown function DUF894, DitE  34.17 
 
 		 533 aa  245  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373  normal  0.254586 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3362  protein of unknown function DUF894 DitE  32.96 
 
 		 569 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4012  protein of unknown function DUF894, DitE  32.96 
 
 		 569 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2303  protein of unknown function DUF894 DitE  30.95 
 
 		 536 aa  236  6e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  36.31 
 
 		 419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  39.34 
 
 		 409 aa  230  4e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4167  protein of unknown function DUF894, DitE  29.62 
 
 		 532 aa  230  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4092  protein of unknown function DUF894, DitE  32.09 
 
 		 519 aa  219  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4649  protein of unknown function DUF894, DitE  32.5 
 
 		 574 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5125  protein of unknown function DUF894 DitE  31.08 
 
 		 542 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1954  hypothetical protein  34.46 
 
 		 433 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2666  MFS permease  34.95 
 
 		 433 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2578  major facilitator family transporter  34.95 
 
 		 433 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.909928  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1414  hypothetical protein  34.71 
 
 		 433 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322764  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2139  hypothetical protein  34.71 
 
 		 433 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3174  hypothetical protein  34.71 
 
 		 433 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.932461  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1637  hypothetical protein  34.71 
 
 		 429 aa  211  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558918  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2524  major facilitator family transporter  34.71 
 
 		 433 aa  210  6e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 		 440 aa  152  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 		 433 aa  150  5e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 442 aa  150  6e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 436 aa  150  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  28.33 
 
 		 431 aa  150  7e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 413 aa  143  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 474 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 441 aa  135  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  26.51 
 
 		 429 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 		 461 aa  127  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 450 aa  124  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  24.65 
 
 		 430 aa  124  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  24.2 
 
 		 418 aa  124  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 421 aa  123  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 		 408 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 407 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  27.88 
 
 		 418 aa  121  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 428 aa  121  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 474 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 		 450 aa  120  9e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 447 aa  118  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 413 aa  118  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 415 aa  118  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 442 aa  117  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 419 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  23.18 
 
 		 412 aa  114  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 421 aa  114  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  25.94 
 
 		 446 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  27.05 
 
 		 424 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>