More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2884 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2884  hypothetical protein  100 
 
 		 543 aa  1058    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  58.13 
 
 		 549 aa  567  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2389  protein of unknown function DUF894 DitE  56.63 
 
 		 549 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0189  hypothetical protein  53.76 
 
 		 539 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  52.99 
 
 		 526 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  48.4 
 
 		 532 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1554  protein of unknown function DUF894 DitE  49.15 
 
 		 553 aa  464  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1578  MFS family transporter  55.83 
 
 		 529 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0176553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  48.75 
 
 		 535 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  48.35 
 
 		 560 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  46.42 
 
 		 532 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1272  protein of unknown function DUF894 DitE  49.23 
 
 		 551 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.951526 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5468  protein of unknown function DUF894 DitE  49.13 
 
 		 535 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5315  putative major facilitator superfamily transporter  46.85 
 
 		 539 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00425912  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29210  putative MFS transporter  49.9 
 
 		 529 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3978  transmembrane transport protein  50 
 
 		 528 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2665  protein of unknown function DUF894, DitE  49.04 
 
 		 542 aa  424  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0627895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42320  major facilitator transpoter  47.9 
 
 		 535 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.956299  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5161  protein of unknown function DUF894, DitE  46.79 
 
 		 532 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0839068 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  44.17 
 
 		 553 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0736  protein of unknown function DUF894, DitE  42.14 
 
 		 539 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2332  protein of unknown function DUF894 DitE  44.81 
 
 		 549 aa  368  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0975452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  41.23 
 
 		 586 aa  359  6e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2303  protein of unknown function DUF894 DitE  41.46 
 
 		 536 aa  355  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  43.1 
 
 		 530 aa  355  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0637  protein of unknown function DUF894, DitE  39.89 
 
 		 536 aa  352  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167725  normal  0.197731 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3362  protein of unknown function DUF894 DitE  44.27 
 
 		 569 aa  349  8e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4012  protein of unknown function DUF894, DitE  44.27 
 
 		 569 aa  349  8e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4092  protein of unknown function DUF894, DitE  43.05 
 
 		 519 aa  349  9e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  38.98 
 
 		 541 aa  346  8e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5125  protein of unknown function DUF894 DitE  41.92 
 
 		 542 aa  343  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3437  protein of unknown function DUF894 DitE  38.8 
 
 		 551 aa  341  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  36.28 
 
 		 542 aa  333  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4649  protein of unknown function DUF894, DitE  43.3 
 
 		 574 aa  332  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4414  protein of unknown function DUF894, DitE  40.58 
 
 		 557 aa  330  3e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.91404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1167  protein of unknown function DUF894, DitE  42.53 
 
 		 529 aa  326  6e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0311  transporter, putative  36.92 
 
 		 542 aa  325  9e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.054545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0287  putative transporter  36.92 
 
 		 542 aa  323  5e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2969  protein of unknown function DUF894, DitE  42.03 
 
 		 561 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.207712 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3361  protein of unknown function DUF894 DitE  37.31 
 
 		 542 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4071  protein of unknown function DUF894 DitE  37.62 
 
 		 543 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19310  hypothetical protein  35.71 
 
 		 571 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1662  hypothetical protein  35.71 
 
 		 572 aa  320  5e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0215  protein of unknown function DUF894, DitE  41.78 
 
 		 533 aa  319  7e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.155573  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0225  protein of unknown function DUF894, DitE  41.78 
 
 		 533 aa  319  7e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.383838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0235  protein of unknown function DUF894, DitE  41.78 
 
 		 533 aa  319  7e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2604  protein of unknown function DUF894, DitE  41.92 
 
 		 541 aa  319  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0945  major facilitator transporter  41.92 
 
 		 541 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3144  MFS family transporter  41.89 
 
 		 541 aa  311  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.631195  normal  0.502456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4167  protein of unknown function DUF894, DitE  36.17 
 
 		 532 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0118  hypothetical protein  37.08 
 
 		 562 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3253  protein of unknown function DUF894, DitE  37.76 
 
 		 533 aa  299  7e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373  normal  0.254586 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0009  protein of unknown function DUF894, DitE  35.45 
 
 		 527 aa  298  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0685  protein of unknown function DUF894, DitE  37.12 
 
 		 562 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.667795 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0090  protein of unknown function DUF894 DitE  36.86 
 
 		 562 aa  280  7e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0448  protein of unknown function DUF894, DitE  35.42 
 
 		 555 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0803  protein of unknown function DUF894, DitE  37.59 
 
 		 544 aa  275  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2025  protein of unknown function DUF894, DitE  34.44 
 
 		 554 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0278  major facilitator superfamily permease  35.41 
 
 		 560 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  42.9 
 
 		 409 aa  248  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  40.1 
 
 		 419 aa  246  4.9999999999999997e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1954  hypothetical protein  38.06 
 
 		 433 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2666  MFS permease  40.21 
 
 		 433 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2578  major facilitator family transporter  40.21 
 
 		 433 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.909928  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2524  major facilitator family transporter  39.95 
 
 		 433 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1414  hypothetical protein  39.63 
 
 		 433 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322764  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1637  hypothetical protein  39.63 
 
 		 429 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3174  hypothetical protein  39.63 
 
 		 433 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.932461  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2139  hypothetical protein  39.63 
 
 		 433 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  34.42 
 
 		 429 aa  187  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 		 433 aa  177  5e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 440 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  32.25 
 
 		 442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 436 aa  172  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 453 aa  162  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  32.42 
 
 		 418 aa  159  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 447 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  30.13 
 
 		 431 aa  153  7e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  32.81 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 407 aa  150  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  25.96 
 
 		 410 aa  147  7.0000000000000006e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 408 aa  146  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 		 456 aa  146  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 450 aa  143  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 441 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 441 aa  141  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 412 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  27.46 
 
 		 403 aa  140  7e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 474 aa  140  7.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 412 aa  140  7.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 476 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  27.72 
 
 		 430 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 415 aa  137  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 413 aa  136  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 426 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 419 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>