More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0118 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0118  hypothetical protein  100 
 
 		 562 aa  1100    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0685  protein of unknown function DUF894, DitE  91.1 
 
 		 562 aa  968    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.667795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0278  major facilitator superfamily permease  74.96 
 
 		 560 aa  743    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0090  protein of unknown function DUF894 DitE  84.88 
 
 		 562 aa  856    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0448  protein of unknown function DUF894, DitE  55.11 
 
 		 555 aa  561  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2025  protein of unknown function DUF894, DitE  51.19 
 
 		 554 aa  526  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4414  protein of unknown function DUF894, DitE  48.67 
 
 		 557 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.91404 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0311  transporter, putative  43.18 
 
 		 542 aa  415  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.054545  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  45.37 
 
 		 542 aa  418  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3437  protein of unknown function DUF894 DitE  45.74 
 
 		 551 aa  415  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  42.32 
 
 		 541 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0287  putative transporter  42.99 
 
 		 542 aa  412  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4071  protein of unknown function DUF894 DitE  47.88 
 
 		 543 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3361  protein of unknown function DUF894 DitE  44.11 
 
 		 542 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0803  protein of unknown function DUF894, DitE  42.99 
 
 		 544 aa  372  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2604  protein of unknown function DUF894, DitE  45.45 
 
 		 541 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0945  major facilitator transporter  45.08 
 
 		 541 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2969  protein of unknown function DUF894, DitE  45.28 
 
 		 561 aa  362  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.207712 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  39.23 
 
 		 526 aa  323  4e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  36.12 
 
 		 532 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  36.21 
 
 		 586 aa  316  7e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1272  protein of unknown function DUF894 DitE  37.04 
 
 		 551 aa  303  5.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.951526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2884  hypothetical protein  37.08 
 
 		 543 aa  299  9e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  36.46 
 
 		 560 aa  295  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  33.65 
 
 		 535 aa  294  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  34.42 
 
 		 553 aa  293  4e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5315  putative major facilitator superfamily transporter  36.56 
 
 		 539 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00425912  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5468  protein of unknown function DUF894 DitE  37.28 
 
 		 535 aa  290  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1662  hypothetical protein  32.77 
 
 		 572 aa  290  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19310  hypothetical protein  32.77 
 
 		 571 aa  289  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1554  protein of unknown function DUF894 DitE  35.7 
 
 		 553 aa  288  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  45.04 
 
 		 419 aa  285  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  33.52 
 
 		 532 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  38.46 
 
 		 530 aa  282  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0736  protein of unknown function DUF894, DitE  35.58 
 
 		 539 aa  281  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3253  protein of unknown function DUF894, DitE  40.8 
 
 		 533 aa  280  5e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373  normal  0.254586 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2303  protein of unknown function DUF894 DitE  37.19 
 
 		 536 aa  278  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42320  major facilitator transpoter  37.14 
 
 		 535 aa  275  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.956299  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3362  protein of unknown function DUF894 DitE  37.55 
 
 		 569 aa  274  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0637  protein of unknown function DUF894, DitE  35.99 
 
 		 536 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167725  normal  0.197731 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4012  protein of unknown function DUF894, DitE  37.55 
 
 		 569 aa  274  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2332  protein of unknown function DUF894 DitE  35.96 
 
 		 549 aa  273  5.000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0975452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0009  protein of unknown function DUF894, DitE  34.59 
 
 		 527 aa  273  8.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29210  putative MFS transporter  34.87 
 
 		 529 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1167  protein of unknown function DUF894, DitE  37.55 
 
 		 529 aa  266  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5125  protein of unknown function DUF894 DitE  37.07 
 
 		 542 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3978  transmembrane transport protein  34.23 
 
 		 528 aa  264  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4092  protein of unknown function DUF894, DitE  35.45 
 
 		 519 aa  264  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2665  protein of unknown function DUF894, DitE  35.07 
 
 		 542 aa  263  8e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0627895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5161  protein of unknown function DUF894, DitE  33.52 
 
 		 532 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0839068 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4167  protein of unknown function DUF894, DitE  34.45 
 
 		 532 aa  262  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1578  MFS family transporter  38.36 
 
 		 529 aa  261  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0176553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  35.23 
 
 		 549 aa  259  8e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0189  hypothetical protein  35.3 
 
 		 539 aa  257  5e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0215  protein of unknown function DUF894, DitE  37.77 
 
 		 533 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.155573  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4649  protein of unknown function DUF894, DitE  35.33 
 
 		 574 aa  254  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0225  protein of unknown function DUF894, DitE  37.77 
 
 		 533 aa  253  6e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.383838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0235  protein of unknown function DUF894, DitE  37.77 
 
 		 533 aa  253  6e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2389  protein of unknown function DUF894 DitE  34.69 
 
 		 549 aa  252  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3144  MFS family transporter  36.38 
 
 		 541 aa  249  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.631195  normal  0.502456 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  42.3 
 
 		 409 aa  243  6e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1954  hypothetical protein  42.47 
 
 		 433 aa  243  7e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1414  hypothetical protein  42.01 
 
 		 433 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322764  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2139  hypothetical protein  42.01 
 
 		 433 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3174  hypothetical protein  42.01 
 
 		 433 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.932461  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1637  hypothetical protein  42.01 
 
 		 429 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558918  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2524  major facilitator family transporter  42.01 
 
 		 433 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2666  MFS permease  41.77 
 
 		 433 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2578  major facilitator family transporter  41.77 
 
 		 433 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.909928  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 436 aa  133  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 442 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 		 421 aa  128  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  28.69 
 
 		 431 aa  127  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 418 aa  126  9e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 417 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 406 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 474 aa  121  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 441 aa  121  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 407 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 415 aa  120  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 405 aa  120  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  25.93 
 
 		 429 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 453 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  29.52 
 
 		 415 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 450 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  24.41 
 
 		 410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 419 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 433 aa  115  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  29.65 
 
 		 418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 426 aa  114  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 428 aa  114  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 413 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 457 aa  113  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  28.52 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 413 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 413 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>