More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0069 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
406 aa  796    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  66.86 
 
 
360 aa  441  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  62.31 
 
 
432 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  62.31 
 
 
432 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  60.31 
 
 
415 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  62.03 
 
 
424 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  58.93 
 
 
419 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  58.06 
 
 
406 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  55.94 
 
 
422 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  59.18 
 
 
403 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  58.31 
 
 
406 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  59.18 
 
 
403 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  57.87 
 
 
409 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  54.45 
 
 
403 aa  413  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  57.5 
 
 
406 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  58.31 
 
 
406 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  58.93 
 
 
412 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  59.95 
 
 
416 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  59.07 
 
 
479 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  59.95 
 
 
416 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  59.95 
 
 
416 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  58.12 
 
 
416 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  56.41 
 
 
420 aa  398  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  57.87 
 
 
416 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  58.42 
 
 
416 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  55.09 
 
 
451 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  52.97 
 
 
405 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  57.25 
 
 
406 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  56.02 
 
 
406 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  57.77 
 
 
408 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  59.69 
 
 
416 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  57.25 
 
 
408 aa  385  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  57.25 
 
 
408 aa  385  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  55.7 
 
 
420 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  54.36 
 
 
408 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  51.31 
 
 
440 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  55.98 
 
 
418 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  57.92 
 
 
421 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  51.16 
 
 
411 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  51.16 
 
 
416 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  54.79 
 
 
415 aa  360  3e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  48.46 
 
 
415 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  57.04 
 
 
424 aa  351  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3653  major facilitator superfamily MFS_1  56.28 
 
 
397 aa  350  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  51.69 
 
 
421 aa  345  6e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2818  hypothetical protein  53.59 
 
 
404 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  52.69 
 
 
423 aa  336  5e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  52.45 
 
 
411 aa  335  9e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  51.55 
 
 
412 aa  332  9e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  50.77 
 
 
410 aa  330  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  48.31 
 
 
413 aa  327  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  46.6 
 
 
427 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  46.6 
 
 
433 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  48 
 
 
410 aa  323  4e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3371  major facilitator transporter  49.11 
 
 
413 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  47.16 
 
 
428 aa  317  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  50.13 
 
 
454 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2480  major facilitator transporter  47.63 
 
 
457 aa  315  8e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  48.89 
 
 
414 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  47.42 
 
 
412 aa  310  4e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1810  putative transporter  48.31 
 
 
412 aa  290  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  45.13 
 
 
403 aa  288  1e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  47.99 
 
 
429 aa  288  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  42.51 
 
 
427 aa  287  2e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  45.48 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2285  major facilitator superfamily transporter  49.73 
 
 
455 aa  279  5e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00827549  hitchhiker  0.000379074 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  40.49 
 
 
411 aa  276  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  41.95 
 
 
437 aa  268  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  43.93 
 
 
499 aa  267  2.9999999999999995e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  43.98 
 
 
421 aa  259  4e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  39.18 
 
 
401 aa  258  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  40.2 
 
 
407 aa  258  2e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  40.38 
 
 
427 aa  251  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  37.94 
 
 
424 aa  249  4e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  38.68 
 
 
425 aa  244  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00357  drug:proton antiporter  38.52 
 
 
410 aa  243  5e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.018305  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  41.46 
 
 
416 aa  243  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  46.19 
 
 
427 aa  242  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  38.38 
 
 
427 aa  239  5e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  38.4 
 
 
415 aa  239  5.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  38.03 
 
 
414 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0279  major facilitator transporter  38.42 
 
 
418 aa  236  7e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4902  major facilitator superfamily MFS_1  40.28 
 
 
414 aa  212  7.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0403357  normal  0.0378794 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 
428 aa  203  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  33.25 
 
 
415 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  35.98 
 
 
524 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  35.5 
 
 
415 aa  179  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  32.72 
 
 
415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  34.43 
 
 
431 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 
445 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  30.87 
 
 
474 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 
422 aa  134  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  29.64 
 
 
418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  30.77 
 
 
426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 
449 aa  130  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 
412 aa  129  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  31.46 
 
 
407 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  30.1 
 
 
447 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>