More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4012 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3362  protein of unknown function DUF894 DitE  99.82 
 
 
569 aa  1112    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5125  protein of unknown function DUF894 DitE  69.05 
 
 
542 aa  670    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0736  protein of unknown function DUF894, DitE  72.59 
 
 
539 aa  739    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  69.47 
 
 
586 aa  716    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4649  protein of unknown function DUF894, DitE  80.14 
 
 
574 aa  803    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0637  protein of unknown function DUF894, DitE  69.69 
 
 
536 aa  701    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167725  normal  0.197731 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4012  protein of unknown function DUF894, DitE  100 
 
 
569 aa  1116    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4092  protein of unknown function DUF894, DitE  79.92 
 
 
519 aa  788    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146023  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2303  protein of unknown function DUF894 DitE  59.61 
 
 
536 aa  554  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1578  MFS family transporter  47.06 
 
 
529 aa  364  3e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0176553  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  43.95 
 
 
526 aa  361  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  42.06 
 
 
532 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  43.7 
 
 
549 aa  347  4e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42320  major facilitator transpoter  43.33 
 
 
535 aa  343  4e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.956299  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2884  hypothetical protein  44.19 
 
 
543 aa  340  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5161  protein of unknown function DUF894, DitE  42.15 
 
 
532 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0839068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3978  transmembrane transport protein  42.83 
 
 
528 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29210  putative MFS transporter  42.26 
 
 
529 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  37.4 
 
 
532 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  37.45 
 
 
553 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  39.74 
 
 
560 aa  320  5e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  38.21 
 
 
535 aa  318  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2665  protein of unknown function DUF894, DitE  41.7 
 
 
542 aa  317  4e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0627895  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1554  protein of unknown function DUF894 DitE  38.74 
 
 
553 aa  313  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5468  protein of unknown function DUF894 DitE  39.81 
 
 
535 aa  309  9e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1272  protein of unknown function DUF894 DitE  39.69 
 
 
551 aa  306  9.000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.951526 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5315  putative major facilitator superfamily transporter  38.84 
 
 
539 aa  302  9e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00425912  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  35.26 
 
 
542 aa  297  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  36.69 
 
 
541 aa  294  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2332  protein of unknown function DUF894 DitE  40.43 
 
 
549 aa  292  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0975452  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3437  protein of unknown function DUF894 DitE  36.87 
 
 
551 aa  283  7.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545505  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4414  protein of unknown function DUF894, DitE  38.74 
 
 
557 aa  281  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.91404 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  38.68 
 
 
530 aa  277  4e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0118  hypothetical protein  37.55 
 
 
562 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1167  protein of unknown function DUF894, DitE  37.16 
 
 
529 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2389  protein of unknown function DUF894 DitE  38 
 
 
549 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4071  protein of unknown function DUF894 DitE  35.45 
 
 
543 aa  269  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0311  transporter, putative  35 
 
 
542 aa  267  4e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.054545  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3144  MFS family transporter  38.88 
 
 
541 aa  266  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.631195  normal  0.502456 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0287  putative transporter  34.81 
 
 
542 aa  264  3e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0189  hypothetical protein  36.1 
 
 
539 aa  264  4e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3361  protein of unknown function DUF894 DitE  35.07 
 
 
542 aa  263  6e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0685  protein of unknown function DUF894, DitE  36.12 
 
 
562 aa  259  9e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.667795 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19310  hypothetical protein  32.02 
 
 
571 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1662  hypothetical protein  32.02 
 
 
572 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0090  protein of unknown function DUF894 DitE  37.79 
 
 
562 aa  250  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2604  protein of unknown function DUF894, DitE  38.74 
 
 
541 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0945  major facilitator transporter  38.55 
 
 
541 aa  246  8e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0225  protein of unknown function DUF894, DitE  37.48 
 
 
533 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.383838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0235  protein of unknown function DUF894, DitE  37.48 
 
 
533 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0215  protein of unknown function DUF894, DitE  37.67 
 
 
533 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.155573  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2969  protein of unknown function DUF894, DitE  38.03 
 
 
561 aa  240  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.207712 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3253  protein of unknown function DUF894, DitE  37.3 
 
 
533 aa  236  9e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373  normal  0.254586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0278  major facilitator superfamily permease  34.91 
 
 
560 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2025  protein of unknown function DUF894, DitE  31.94 
 
 
554 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0009  protein of unknown function DUF894, DitE  33.01 
 
 
527 aa  231  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0803  protein of unknown function DUF894, DitE  35.43 
 
 
544 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288414  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4167  protein of unknown function DUF894, DitE  33.97 
 
 
532 aa  219  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0448  protein of unknown function DUF894, DitE  30.67 
 
 
555 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  37.37 
 
 
419 aa  205  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  38.23 
 
 
409 aa  196  9e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1954  hypothetical protein  34.31 
 
 
433 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2666  MFS permease  34.31 
 
 
433 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2578  major facilitator family transporter  34.31 
 
 
433 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.909928  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2524  major facilitator family transporter  34.31 
 
 
433 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1414  hypothetical protein  34.04 
 
 
433 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322764  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1637  hypothetical protein  34.04 
 
 
429 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558918  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2139  hypothetical protein  34.04 
 
 
433 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3174  hypothetical protein  34.04 
 
 
433 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.932461  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  29.18 
 
 
447 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 
453 aa  154  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  30.19 
 
 
446 aa  150  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 
442 aa  141  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  30.39 
 
 
450 aa  141  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  29.27 
 
 
407 aa  140  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  30.62 
 
 
426 aa  139  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  30.56 
 
 
441 aa  137  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 
412 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 
441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  28.73 
 
 
436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 
440 aa  133  6.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 
494 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  27.23 
 
 
430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  28.72 
 
 
418 aa  132  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  26.61 
 
 
403 aa  131  3e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 
440 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  24.93 
 
 
412 aa  126  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  30.79 
 
 
426 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  27.65 
 
 
474 aa  124  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 
431 aa  125  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 
417 aa  124  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  33.09 
 
 
491 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 
433 aa  124  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  25.63 
 
 
418 aa  124  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  27.21 
 
 
429 aa  123  8e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 
401 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  23.5 
 
 
413 aa  123  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 
461 aa  121  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 
456 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
419 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>