More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2969 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0311  transporter, putative  67.66 
 
 		 542 aa  706    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.054545  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3437  protein of unknown function DUF894 DitE  62.52 
 
 		 551 aa  639    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3361  protein of unknown function DUF894 DitE  66.98 
 
 		 542 aa  692    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0945  major facilitator transporter  93.9 
 
 		 541 aa  858    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2969  protein of unknown function DUF894, DitE  100 
 
 		 561 aa  1093    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.207712 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0287  putative transporter  67.47 
 
 		 542 aa  703    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  60.04 
 
 		 542 aa  641    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  66.48 
 
 		 541 aa  703    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2604  protein of unknown function DUF894, DitE  93.9 
 
 		 541 aa  860    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4071  protein of unknown function DUF894 DitE  62.88 
 
 		 543 aa  597  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0803  protein of unknown function DUF894, DitE  60.45 
 
 		 544 aa  550  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4414  protein of unknown function DUF894, DitE  56.02 
 
 		 557 aa  509  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.91404 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0685  protein of unknown function DUF894, DitE  44.44 
 
 		 562 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.667795 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0448  protein of unknown function DUF894, DitE  44.3 
 
 		 555 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0118  hypothetical protein  45.28 
 
 		 562 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3253  protein of unknown function DUF894, DitE  49.13 
 
 		 533 aa  383  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373  normal  0.254586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0278  major facilitator superfamily permease  45.03 
 
 		 560 aa  382  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0090  protein of unknown function DUF894 DitE  44.38 
 
 		 562 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2884  hypothetical protein  42.69 
 
 		 543 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2025  protein of unknown function DUF894, DitE  39.92 
 
 		 554 aa  352  8e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1272  protein of unknown function DUF894 DitE  40.97 
 
 		 551 aa  345  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.951526 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  39.92 
 
 		 532 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  41.83 
 
 		 526 aa  337  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  41.65 
 
 		 549 aa  330  4e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1554  protein of unknown function DUF894 DitE  40.78 
 
 		 553 aa  329  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19310  hypothetical protein  36.95 
 
 		 571 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1662  hypothetical protein  36.95 
 
 		 572 aa  326  6e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  37.35 
 
 		 532 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  37.69 
 
 		 586 aa  321  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5468  protein of unknown function DUF894 DitE  41.81 
 
 		 535 aa  320  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  40.37 
 
 		 530 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2303  protein of unknown function DUF894 DitE  39.17 
 
 		 536 aa  319  9e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42320  major facilitator transpoter  41.25 
 
 		 535 aa  317  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.956299  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5315  putative major facilitator superfamily transporter  39.73 
 
 		 539 aa  317  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00425912  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  38.45 
 
 		 535 aa  316  9e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2665  protein of unknown function DUF894, DitE  39.1 
 
 		 542 aa  315  9e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0627895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29210  putative MFS transporter  40.34 
 
 		 529 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  39.22 
 
 		 560 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  45.53 
 
 		 419 aa  312  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  37.6 
 
 		 553 aa  310  5.9999999999999995e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2332  protein of unknown function DUF894 DitE  40.53 
 
 		 549 aa  309  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0975452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3978  transmembrane transport protein  39.96 
 
 		 528 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1167  protein of unknown function DUF894, DitE  40.91 
 
 		 529 aa  307  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0189  hypothetical protein  40.61 
 
 		 539 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0736  protein of unknown function DUF894, DitE  38.23 
 
 		 539 aa  306  8.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1578  MFS family transporter  42.94 
 
 		 529 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0176553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2389  protein of unknown function DUF894 DitE  40.3 
 
 		 549 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5161  protein of unknown function DUF894, DitE  37.55 
 
 		 532 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0839068 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0637  protein of unknown function DUF894, DitE  38.17 
 
 		 536 aa  300  5e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167725  normal  0.197731 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4092  protein of unknown function DUF894, DitE  38.97 
 
 		 519 aa  295  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0215  protein of unknown function DUF894, DitE  41.62 
 
 		 533 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.155573  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0225  protein of unknown function DUF894, DitE  41.21 
 
 		 533 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.383838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0235  protein of unknown function DUF894, DitE  41.21 
 
 		 533 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4649  protein of unknown function DUF894, DitE  38.92 
 
 		 574 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4012  protein of unknown function DUF894, DitE  37.93 
 
 		 569 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3362  protein of unknown function DUF894 DitE  37.93 
 
 		 569 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0009  protein of unknown function DUF894, DitE  36.38 
 
 		 527 aa  282  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  45.88 
 
 		 409 aa  281  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3144  MFS family transporter  39.77 
 
 		 541 aa  276  9e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.631195  normal  0.502456 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5125  protein of unknown function DUF894 DitE  35.18 
 
 		 542 aa  264  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4167  protein of unknown function DUF894, DitE  35.12 
 
 		 532 aa  253  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1954  hypothetical protein  39.95 
 
 		 433 aa  232  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2666  MFS permease  40.2 
 
 		 433 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2578  major facilitator family transporter  40.2 
 
 		 433 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.909928  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1637  hypothetical protein  39.95 
 
 		 429 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558918  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1414  hypothetical protein  39.95 
 
 		 433 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322764  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2139  hypothetical protein  39.95 
 
 		 433 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3174  hypothetical protein  39.95 
 
 		 433 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.932461  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2524  major facilitator family transporter  39.95 
 
 		 433 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 		 453 aa  159  9e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 461 aa  156  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 407 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 410 aa  152  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 474 aa  153  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 433 aa  150  5e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  26.18 
 
 		 410 aa  150  5e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 412 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  31.03 
 
 		 418 aa  148  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 		 440 aa  145  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 436 aa  144  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 450 aa  142  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 418 aa  141  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  29.27 
 
 		 429 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 410 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 413 aa  140  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 404 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 		 417 aa  139  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  33.78 
 
 		 413 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 441 aa  137  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 		 421 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  29.19 
 
 		 431 aa  136  8e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 494 aa  136  9e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  27.99 
 
 		 430 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 435 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 		 442 aa  133  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  27.48 
 
 		 403 aa  133  7.999999999999999e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 441 aa  133  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 474 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  30 
 
 		 447 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>