More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4167 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4167  protein of unknown function DUF894, DitE  100 
 
 		 532 aa  1044    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0009  protein of unknown function DUF894, DitE  78.29 
 
 		 527 aa  787    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  38.4 
 
 		 526 aa  301  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  37.96 
 
 		 530 aa  291  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  35.52 
 
 		 549 aa  288  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2884  hypothetical protein  36.17 
 
 		 543 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  35.33 
 
 		 535 aa  280  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  35.58 
 
 		 553 aa  279  8e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  35.22 
 
 		 532 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4414  protein of unknown function DUF894, DitE  36.1 
 
 		 557 aa  272  9e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.91404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2025  protein of unknown function DUF894, DitE  34.72 
 
 		 554 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1272  protein of unknown function DUF894 DitE  36.28 
 
 		 551 aa  270  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.951526 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29210  putative MFS transporter  37.07 
 
 		 529 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42320  major facilitator transpoter  37.43 
 
 		 535 aa  268  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.956299  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0118  hypothetical protein  34.16 
 
 		 562 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3978  transmembrane transport protein  37.05 
 
 		 528 aa  267  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1167  protein of unknown function DUF894, DitE  36.69 
 
 		 529 aa  266  7e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  32.57 
 
 		 532 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4071  protein of unknown function DUF894 DitE  33.27 
 
 		 543 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0225  protein of unknown function DUF894, DitE  38.02 
 
 		 533 aa  262  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.383838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0235  protein of unknown function DUF894, DitE  38.02 
 
 		 533 aa  262  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  35.69 
 
 		 560 aa  262  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5468  protein of unknown function DUF894 DitE  35.31 
 
 		 535 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0685  protein of unknown function DUF894, DitE  34.97 
 
 		 562 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.667795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0215  protein of unknown function DUF894, DitE  38.21 
 
 		 533 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.155573  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2665  protein of unknown function DUF894, DitE  35.58 
 
 		 542 aa  260  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0627895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0090  protein of unknown function DUF894 DitE  35.91 
 
 		 562 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1554  protein of unknown function DUF894 DitE  34.39 
 
 		 553 aa  258  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3437  protein of unknown function DUF894 DitE  33.27 
 
 		 551 aa  257  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0278  major facilitator superfamily permease  36.29 
 
 		 560 aa  257  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5161  protein of unknown function DUF894, DitE  34.65 
 
 		 532 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0839068 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1578  MFS family transporter  38.81 
 
 		 529 aa  254  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0176553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0189  hypothetical protein  32.96 
 
 		 539 aa  253  6e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  31.67 
 
 		 542 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2303  protein of unknown function DUF894 DitE  35.63 
 
 		 536 aa  250  5e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0448  protein of unknown function DUF894, DitE  35.55 
 
 		 555 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  33.33 
 
 		 586 aa  249  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2389  protein of unknown function DUF894 DitE  33.27 
 
 		 549 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  31.99 
 
 		 541 aa  241  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0736  protein of unknown function DUF894, DitE  33.96 
 
 		 539 aa  238  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1662  hypothetical protein  30.74 
 
 		 572 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19310  hypothetical protein  30.74 
 
 		 571 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0637  protein of unknown function DUF894, DitE  33.02 
 
 		 536 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167725  normal  0.197731 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5315  putative major facilitator superfamily transporter  34.47 
 
 		 539 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00425912  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0311  transporter, putative  32.72 
 
 		 542 aa  228  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.054545  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3361  protein of unknown function DUF894 DitE  31.2 
 
 		 542 aa  226  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0287  putative transporter  32.53 
 
 		 542 aa  224  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4649  protein of unknown function DUF894, DitE  35.11 
 
 		 574 aa  221  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5125  protein of unknown function DUF894 DitE  34.84 
 
 		 542 aa  219  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0803  protein of unknown function DUF894, DitE  33.27 
 
 		 544 aa  219  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4092  protein of unknown function DUF894, DitE  33.27 
 
 		 519 aa  219  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2604  protein of unknown function DUF894, DitE  34.4 
 
 		 541 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0945  major facilitator transporter  34.4 
 
 		 541 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2969  protein of unknown function DUF894, DitE  35.12 
 
 		 561 aa  217  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.207712 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3253  protein of unknown function DUF894, DitE  35.28 
 
 		 533 aa  214  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373  normal  0.254586 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  36.76 
 
 		 419 aa  213  7.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2332  protein of unknown function DUF894 DitE  33.14 
 
 		 549 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0975452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3362  protein of unknown function DUF894 DitE  34.22 
 
 		 569 aa  212  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4012  protein of unknown function DUF894, DitE  34.22 
 
 		 569 aa  212  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3144  MFS family transporter  32.32 
 
 		 541 aa  203  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.631195  normal  0.502456 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  37.53 
 
 		 409 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1637  hypothetical protein  35.04 
 
 		 429 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558918  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1414  hypothetical protein  35.04 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322764  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2139  hypothetical protein  35.04 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3174  hypothetical protein  35.04 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.932461  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1954  hypothetical protein  33.33 
 
 		 433 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2524  major facilitator family transporter  34.79 
 
 		 433 aa  167  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2666  MFS permease  34.72 
 
 		 433 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2578  major facilitator family transporter  34.72 
 
 		 433 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.909928  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 447 aa  124  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 415 aa  123  9e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 440 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  26.17 
 
 		 431 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 450 aa  116  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 412 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 474 aa  116  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  28.93 
 
 		 429 aa  115  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 456 aa  113  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 		 450 aa  113  9e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 441 aa  113  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 441 aa  113  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 417 aa  111  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 		 408 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 442 aa  110  7.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  25.96 
 
 		 430 aa  108  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 433 aa  107  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  30.56 
 
 		 446 aa  107  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 418 aa  106  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 435 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 407 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  27.05 
 
 		 418 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  30.17 
 
 		 426 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>