More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_29210 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  68.95 
 
 		 532 aa  693    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42320  major facilitator transpoter  86.77 
 
 		 535 aa  810    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.956299  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5161  protein of unknown function DUF894, DitE  69.52 
 
 		 532 aa  674    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0839068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3978  transmembrane transport protein  97.54 
 
 		 528 aa  898    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29210  putative MFS transporter  100 
 
 		 529 aa  1021    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2665  protein of unknown function DUF894, DitE  76.86 
 
 		 542 aa  717    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0627895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  49.81 
 
 		 553 aa  473  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  49.04 
 
 		 549 aa  430  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2884  hypothetical protein  49.9 
 
 		 543 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1578  MFS family transporter  54.35 
 
 		 529 aa  424  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0176553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2332  protein of unknown function DUF894 DitE  49.71 
 
 		 549 aa  422  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0975452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  47.33 
 
 		 526 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1554  protein of unknown function DUF894 DitE  46.07 
 
 		 553 aa  411  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1272  protein of unknown function DUF894 DitE  44.34 
 
 		 551 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.951526 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  43.88 
 
 		 532 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  43.19 
 
 		 535 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  45.79 
 
 		 560 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5315  putative major facilitator superfamily transporter  43.59 
 
 		 539 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00425912  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5468  protein of unknown function DUF894 DitE  44.59 
 
 		 535 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0189  hypothetical protein  44.38 
 
 		 539 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0736  protein of unknown function DUF894, DitE  44.11 
 
 		 539 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  42.83 
 
 		 586 aa  371  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  42.78 
 
 		 530 aa  359  6e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2389  protein of unknown function DUF894 DitE  43.48 
 
 		 549 aa  355  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0637  protein of unknown function DUF894, DitE  42.48 
 
 		 536 aa  351  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167725  normal  0.197731 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  38.59 
 
 		 541 aa  344  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  38.66 
 
 		 542 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2303  protein of unknown function DUF894 DitE  40.34 
 
 		 536 aa  338  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3362  protein of unknown function DUF894 DitE  43.28 
 
 		 569 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4012  protein of unknown function DUF894, DitE  43.28 
 
 		 569 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4649  protein of unknown function DUF894, DitE  42.39 
 
 		 574 aa  332  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0311  transporter, putative  39.76 
 
 		 542 aa  330  4e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.054545  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5125  protein of unknown function DUF894 DitE  41.38 
 
 		 542 aa  329  8e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0215  protein of unknown function DUF894, DitE  42.56 
 
 		 533 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.155573  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0225  protein of unknown function DUF894, DitE  42.37 
 
 		 533 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.383838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0235  protein of unknown function DUF894, DitE  42.37 
 
 		 533 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1167  protein of unknown function DUF894, DitE  42.26 
 
 		 529 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4414  protein of unknown function DUF894, DitE  38.62 
 
 		 557 aa  327  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.91404 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0287  putative transporter  39.56 
 
 		 542 aa  327  4.0000000000000003e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4092  protein of unknown function DUF894, DitE  42.91 
 
 		 519 aa  325  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3144  MFS family transporter  42.94 
 
 		 541 aa  322  8e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.631195  normal  0.502456 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3437  protein of unknown function DUF894 DitE  40.28 
 
 		 551 aa  322  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3361  protein of unknown function DUF894 DitE  39.76 
 
 		 542 aa  315  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4071  protein of unknown function DUF894 DitE  38.76 
 
 		 543 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2969  protein of unknown function DUF894, DitE  40.34 
 
 		 561 aa  296  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.207712 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0945  major facilitator transporter  39.77 
 
 		 541 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0009  protein of unknown function DUF894, DitE  37.02 
 
 		 527 aa  294  3e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2604  protein of unknown function DUF894, DitE  39.77 
 
 		 541 aa  294  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19310  hypothetical protein  36.61 
 
 		 571 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1662  hypothetical protein  36.61 
 
 		 572 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0448  protein of unknown function DUF894, DitE  36.99 
 
 		 555 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0803  protein of unknown function DUF894, DitE  38.93 
 
 		 544 aa  288  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4167  protein of unknown function DUF894, DitE  37.07 
 
 		 532 aa  284  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0118  hypothetical protein  36.14 
 
 		 562 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0685  protein of unknown function DUF894, DitE  35.12 
 
 		 562 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.667795 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2025  protein of unknown function DUF894, DitE  34.82 
 
 		 554 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  40.54 
 
 		 419 aa  260  5.0000000000000005e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0278  major facilitator superfamily permease  36.29 
 
 		 560 aa  252  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0090  protein of unknown function DUF894 DitE  35.58 
 
 		 562 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3253  protein of unknown function DUF894, DitE  36.49 
 
 		 533 aa  249  8e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373  normal  0.254586 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  39.89 
 
 		 409 aa  229  7e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 447 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1954  hypothetical protein  34.49 
 
 		 433 aa  163  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1637  hypothetical protein  34.89 
 
 		 429 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558918  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1414  hypothetical protein  34.89 
 
 		 433 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322764  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2524  major facilitator family transporter  35.14 
 
 		 433 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2139  hypothetical protein  34.89 
 
 		 433 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3174  hypothetical protein  34.89 
 
 		 433 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.932461  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  34.63 
 
 		 450 aa  160  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2666  MFS permease  34.89 
 
 		 433 aa  160  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2578  major facilitator family transporter  34.89 
 
 		 433 aa  160  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.909928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  31.76 
 
 		 446 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  30.18 
 
 		 424 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 474 aa  156  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  35.23 
 
 		 426 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  28.64 
 
 		 403 aa  153  8e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 441 aa  151  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 453 aa  151  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 413 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  29.92 
 
 		 429 aa  150  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 414 aa  148  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  34.69 
 
 		 418 aa  148  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 474 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 407 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 419 aa  146  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  34.86 
 
 		 418 aa  146  9e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 		 461 aa  146  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 435 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  34.14 
 
 		 414 aa  143  9e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  25.98 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 		 401 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 442 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 421 aa  141  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  28.89 
 
 		 431 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  31.39 
 
 		 440 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 410 aa  140  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 436 aa  140  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>