More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5315 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  63.31 
 
 		 532 aa  655    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  62.67 
 
 		 535 aa  642    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5315  putative major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 539 aa  1051    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00425912  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1554  protein of unknown function DUF894 DitE  65.28 
 
 		 553 aa  649    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5468  protein of unknown function DUF894 DitE  65.7 
 
 		 535 aa  635    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  65.15 
 
 		 560 aa  649    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1272  protein of unknown function DUF894 DitE  64.74 
 
 		 551 aa  629  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.951526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2884  hypothetical protein  46.85 
 
 		 543 aa  425  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  45.68 
 
 		 549 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  45.59 
 
 		 526 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  41.98 
 
 		 553 aa  392  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  41.14 
 
 		 532 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29210  putative MFS transporter  43.59 
 
 		 529 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42320  major facilitator transpoter  42.4 
 
 		 535 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.956299  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3978  transmembrane transport protein  43.02 
 
 		 528 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2665  protein of unknown function DUF894, DitE  42.77 
 
 		 542 aa  368  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0627895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0189  hypothetical protein  43.13 
 
 		 539 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2389  protein of unknown function DUF894 DitE  44.27 
 
 		 549 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5161  protein of unknown function DUF894, DitE  41.33 
 
 		 532 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0839068 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  39.35 
 
 		 586 aa  347  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1578  MFS family transporter  43.3 
 
 		 529 aa  343  5.999999999999999e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0176553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2332  protein of unknown function DUF894 DitE  40 
 
 		 549 aa  338  1.9999999999999998e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0975452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2303  protein of unknown function DUF894 DitE  40.19 
 
 		 536 aa  336  7e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0637  protein of unknown function DUF894, DitE  39.52 
 
 		 536 aa  327  3e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167725  normal  0.197731 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0311  transporter, putative  39.05 
 
 		 542 aa  327  4.0000000000000003e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.054545  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0736  protein of unknown function DUF894, DitE  39.12 
 
 		 539 aa  325  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0287  putative transporter  38.86 
 
 		 542 aa  324  3e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  38.37 
 
 		 530 aa  317  3e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3361  protein of unknown function DUF894 DitE  38.67 
 
 		 542 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  36.77 
 
 		 541 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3437  protein of unknown function DUF894 DitE  38.31 
 
 		 551 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19310  hypothetical protein  37.45 
 
 		 571 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1662  hypothetical protein  37.45 
 
 		 572 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3362  protein of unknown function DUF894 DitE  38.84 
 
 		 569 aa  302  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4012  protein of unknown function DUF894, DitE  38.84 
 
 		 569 aa  302  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4414  protein of unknown function DUF894, DitE  37.94 
 
 		 557 aa  299  9e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.91404 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  35.11 
 
 		 542 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4092  protein of unknown function DUF894, DitE  38.57 
 
 		 519 aa  296  9e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0118  hypothetical protein  36.56 
 
 		 562 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1167  protein of unknown function DUF894, DitE  37.67 
 
 		 529 aa  291  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0803  protein of unknown function DUF894, DitE  38.33 
 
 		 544 aa  289  7e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3144  MFS family transporter  37.64 
 
 		 541 aa  286  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.631195  normal  0.502456 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5125  protein of unknown function DUF894 DitE  38.67 
 
 		 542 aa  286  7e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0685  protein of unknown function DUF894, DitE  35.98 
 
 		 562 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.667795 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0225  protein of unknown function DUF894, DitE  37.04 
 
 		 533 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.383838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0235  protein of unknown function DUF894, DitE  37.04 
 
 		 533 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0215  protein of unknown function DUF894, DitE  37.24 
 
 		 533 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.155573  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2604  protein of unknown function DUF894, DitE  39.73 
 
 		 541 aa  282  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2969  protein of unknown function DUF894, DitE  39.73 
 
 		 561 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.207712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0278  major facilitator superfamily permease  37.9 
 
 		 560 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0945  major facilitator transporter  39.54 
 
 		 541 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4649  protein of unknown function DUF894, DitE  37.43 
 
 		 574 aa  279  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0090  protein of unknown function DUF894 DitE  36.24 
 
 		 562 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4071  protein of unknown function DUF894 DitE  36.88 
 
 		 543 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0448  protein of unknown function DUF894, DitE  34.03 
 
 		 555 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2025  protein of unknown function DUF894, DitE  33.21 
 
 		 554 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0009  protein of unknown function DUF894, DitE  33.46 
 
 		 527 aa  250  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3253  protein of unknown function DUF894, DitE  35.29 
 
 		 533 aa  241  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373  normal  0.254586 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4167  protein of unknown function DUF894, DitE  34.03 
 
 		 532 aa  239  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  35.29 
 
 		 419 aa  213  5.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  37.16 
 
 		 409 aa  203  5e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2578  major facilitator family transporter  35.38 
 
 		 433 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.909928  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2666  MFS permease  35.38 
 
 		 433 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3174  hypothetical protein  35.14 
 
 		 433 aa  187  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.932461  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1414  hypothetical protein  35.14 
 
 		 433 aa  187  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322764  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2139  hypothetical protein  35.14 
 
 		 433 aa  187  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1637  hypothetical protein  35.14 
 
 		 429 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558918  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2524  major facilitator family transporter  35.14 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1954  hypothetical protein  34.13 
 
 		 433 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 		 453 aa  160  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 442 aa  153  8.999999999999999e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 447 aa  147  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 419 aa  146  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 436 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 474 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  27.8 
 
 		 426 aa  140  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 415 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 417 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 441 aa  138  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  26.73 
 
 		 430 aa  137  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  28.42 
 
 		 424 aa  136  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  31.55 
 
 		 452 aa  136  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 431 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  29.02 
 
 		 431 aa  131  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  30.15 
 
 		 418 aa  131  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 417 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 412 aa  130  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 433 aa  130  9.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 426 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 415 aa  128  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  29.53 
 
 		 446 aa  127  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 421 aa  127  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 413 aa  126  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 428 aa  127  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>