More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2668 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0311  transporter, putative  71.72 
 
 		 542 aa  757    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.054545  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3361  protein of unknown function DUF894 DitE  71.91 
 
 		 542 aa  744    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0287  putative transporter  71.54 
 
 		 542 aa  754    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3437  protein of unknown function DUF894 DitE  66.73 
 
 		 551 aa  686    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4071  protein of unknown function DUF894 DitE  65.08 
 
 		 543 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  62.4 
 
 		 542 aa  657    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  100 
 
 		 541 aa  1082    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2604  protein of unknown function DUF894, DitE  66.54 
 
 		 541 aa  608  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0945  major facilitator transporter  66.54 
 
 		 541 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2969  protein of unknown function DUF894, DitE  66.48 
 
 		 561 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.207712 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0803  protein of unknown function DUF894, DitE  60.41 
 
 		 544 aa  592  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4414  protein of unknown function DUF894, DitE  54.01 
 
 		 557 aa  509  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.91404 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0685  protein of unknown function DUF894, DitE  44.17 
 
 		 562 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.667795 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0448  protein of unknown function DUF894, DitE  43.63 
 
 		 555 aa  403  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0118  hypothetical protein  42.48 
 
 		 562 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0278  major facilitator superfamily permease  44.34 
 
 		 560 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3253  protein of unknown function DUF894, DitE  47.07 
 
 		 533 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373  normal  0.254586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0090  protein of unknown function DUF894 DitE  43.19 
 
 		 562 aa  359  9e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2025  protein of unknown function DUF894, DitE  37.19 
 
 		 554 aa  353  5e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1272  protein of unknown function DUF894 DitE  39 
 
 		 551 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.951526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  38.52 
 
 		 532 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2884  hypothetical protein  38.98 
 
 		 543 aa  329  8e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  36.33 
 
 		 535 aa  324  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  38.82 
 
 		 549 aa  322  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29210  putative MFS transporter  38.59 
 
 		 529 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  36.1 
 
 		 532 aa  319  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  36.8 
 
 		 586 aa  319  7.999999999999999e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  38.81 
 
 		 526 aa  318  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  37.22 
 
 		 560 aa  317  4e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2665  protein of unknown function DUF894, DitE  39.43 
 
 		 542 aa  317  5e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0627895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3978  transmembrane transport protein  38.77 
 
 		 528 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  45.11 
 
 		 419 aa  314  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5161  protein of unknown function DUF894, DitE  38.72 
 
 		 532 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0839068 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5468  protein of unknown function DUF894 DitE  39.35 
 
 		 535 aa  310  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42320  major facilitator transpoter  39.09 
 
 		 535 aa  310  5.9999999999999995e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.956299  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2332  protein of unknown function DUF894 DitE  39.43 
 
 		 549 aa  310  5.9999999999999995e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0975452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1554  protein of unknown function DUF894 DitE  37.26 
 
 		 553 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  36.99 
 
 		 553 aa  307  3e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  38.34 
 
 		 530 aa  307  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19310  hypothetical protein  34.58 
 
 		 571 aa  301  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2389  protein of unknown function DUF894 DitE  38.79 
 
 		 549 aa  300  6e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5315  putative major facilitator superfamily transporter  36.77 
 
 		 539 aa  299  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00425912  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1662  hypothetical protein  34.58 
 
 		 572 aa  299  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1167  protein of unknown function DUF894, DitE  38.62 
 
 		 529 aa  297  4e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2303  protein of unknown function DUF894 DitE  37.28 
 
 		 536 aa  296  5e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0215  protein of unknown function DUF894, DitE  38.36 
 
 		 533 aa  289  9e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.155573  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1578  MFS family transporter  39.42 
 
 		 529 aa  288  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0176553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0225  protein of unknown function DUF894, DitE  38.16 
 
 		 533 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.383838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0235  protein of unknown function DUF894, DitE  38.16 
 
 		 533 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0736  protein of unknown function DUF894, DitE  35.96 
 
 		 539 aa  283  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  45.22 
 
 		 409 aa  281  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0189  hypothetical protein  35.88 
 
 		 539 aa  279  9e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0637  protein of unknown function DUF894, DitE  34.67 
 
 		 536 aa  278  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167725  normal  0.197731 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4012  protein of unknown function DUF894, DitE  36.69 
 
 		 569 aa  276  8e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3362  protein of unknown function DUF894 DitE  36.69 
 
 		 569 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4092  protein of unknown function DUF894, DitE  36.28 
 
 		 519 aa  269  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0009  protein of unknown function DUF894, DitE  32.44 
 
 		 527 aa  262  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4649  protein of unknown function DUF894, DitE  36.8 
 
 		 574 aa  257  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3144  MFS family transporter  36.45 
 
 		 541 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.631195  normal  0.502456 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5125  protein of unknown function DUF894 DitE  33.46 
 
 		 542 aa  243  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1954  hypothetical protein  37.98 
 
 		 433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4167  protein of unknown function DUF894, DitE  31.99 
 
 		 532 aa  236  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2666  MFS permease  38.26 
 
 		 433 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2578  major facilitator family transporter  38.26 
 
 		 433 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.909928  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1637  hypothetical protein  38.01 
 
 		 429 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558918  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1414  hypothetical protein  38.01 
 
 		 433 aa  225  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322764  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3174  hypothetical protein  38.01 
 
 		 433 aa  225  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.932461  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2139  hypothetical protein  38.01 
 
 		 433 aa  225  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2524  major facilitator family transporter  38.01 
 
 		 433 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 433 aa  183  6e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 450 aa  167  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 442 aa  158  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 410 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 406 aa  156  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  30.55 
 
 		 429 aa  155  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 407 aa  156  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 441 aa  154  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  30 
 
 		 413 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  29.17 
 
 		 431 aa  151  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 450 aa  151  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 418 aa  151  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 412 aa  151  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  29 
 
 		 418 aa  150  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 436 aa  150  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 440 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  29.79 
 
 		 413 aa  146  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 453 aa  146  9e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  28.69 
 
 		 410 aa  144  4e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  31.92 
 
 		 461 aa  143  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  29.95 
 
 		 452 aa  143  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 447 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 474 aa  139  8.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  30.21 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 404 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 421 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 491 aa  137  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  26.79 
 
 		 430 aa  136  8e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>