More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5002 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  80.05 
 
 		 446 aa  723    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  80.95 
 
 		 446 aa  730    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  100 
 
 		 441 aa  881    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  69.95 
 
 		 419 aa  550  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  66.08 
 
 		 413 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  66.08 
 
 		 413 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  65.83 
 
 		 404 aa  523  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  66.08 
 
 		 413 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  66.41 
 
 		 416 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  66.93 
 
 		 402 aa  520  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  67.34 
 
 		 412 aa  511  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  70.19 
 
 		 428 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  64.62 
 
 		 418 aa  509  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  65 
 
 		 405 aa  506  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  67.09 
 
 		 416 aa  500  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  51.99 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  49.75 
 
 		 406 aa  410  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  53.38 
 
 		 450 aa  402  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  51.84 
 
 		 412 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  48.1 
 
 		 441 aa  398  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  50.91 
 
 		 456 aa  390  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  48.12 
 
 		 452 aa  376  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  51.31 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  49.09 
 
 		 457 aa  359  5e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  50.25 
 
 		 419 aa  351  1e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  47.54 
 
 		 426 aa  351  1e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  49.75 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  47.21 
 
 		 420 aa  343  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  46.46 
 
 		 424 aa  342  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  51.35 
 
 		 418 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  46.05 
 
 		 432 aa  330  3e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  45.36 
 
 		 413 aa  322  7e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  45.27 
 
 		 403 aa  318  9e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  43.96 
 
 		 414 aa  312  7.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  46.47 
 
 		 452 aa  308  9e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  45.68 
 
 		 424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 		 425 aa  296  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  44.95 
 
 		 429 aa  295  1e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  47.43 
 
 		 442 aa  290  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  44.15 
 
 		 405 aa  289  6e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 441 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  43.97 
 
 		 476 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 426 aa  275  9e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  41.91 
 
 		 426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  42.16 
 
 		 436 aa  269  8e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  43.78 
 
 		 450 aa  267  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 		 417 aa  266  7e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  40.25 
 
 		 435 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  37.87 
 
 		 509 aa  263  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  40.15 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  38.03 
 
 		 431 aa  258  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3670  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 		 475 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  36.62 
 
 		 494 aa  248  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  41.78 
 
 		 412 aa  246  8e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  35.98 
 
 		 430 aa  237  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  38.38 
 
 		 429 aa  231  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  35.42 
 
 		 426 aa  223  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  35.82 
 
 		 431 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  39.4 
 
 		 491 aa  219  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 		 418 aa  219  7e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  37.01 
 
 		 421 aa  216  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 		 410 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  37.4 
 
 		 418 aa  213  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  34.01 
 
 		 433 aa  209  6e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  36.98 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  35.04 
 
 		 474 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  35.35 
 
 		 446 aa  205  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  32.42 
 
 		 423 aa  205  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 409 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 412 aa  202  7e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 		 412 aa  202  8e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3120  major facilitator superfamily MFS_1  37.93 
 
 		 428 aa  200  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 		 440 aa  199  7.999999999999999e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  31.71 
 
 		 403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 447 aa  195  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  36.68 
 
 		 441 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  31.66 
 
 		 410 aa  194  2e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 474 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 436 aa  193  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  36.9 
 
 		 413 aa  193  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 440 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  32.75 
 
 		 431 aa  190  5e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 418 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 		 442 aa  187  4e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  35.52 
 
 		 404 aa  186  8e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3320  major facilitator transporter  38.17 
 
 		 425 aa  185  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104451  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  32.92 
 
 		 428 aa  183  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 		 419 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  30.24 
 
 		 417 aa  179  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 414 aa  176  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  32.54 
 
 		 424 aa  176  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  31.66 
 
 		 429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  33.57 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 		 378 aa  170  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 		 413 aa  169  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 410 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>