More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0235 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0215  protein of unknown function DUF894, DitE  99.62 
 
 
533 aa  1032    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.155573  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0225  protein of unknown function DUF894, DitE  100 
 
 
533 aa  1036    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.383838  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  70.7 
 
 
530 aa  704    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0235  protein of unknown function DUF894, DitE  100 
 
 
533 aa  1036    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1167  protein of unknown function DUF894, DitE  72.55 
 
 
529 aa  698    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3144  MFS family transporter  45.32 
 
 
541 aa  357  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.631195  normal  0.502456 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  41.94 
 
 
526 aa  355  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  38.93 
 
 
532 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42320  major facilitator transpoter  42.67 
 
 
535 aa  346  5e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.956299  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29210  putative MFS transporter  41.98 
 
 
529 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2665  protein of unknown function DUF894, DitE  43.03 
 
 
542 aa  343  5e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0627895  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3978  transmembrane transport protein  42.34 
 
 
528 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  38.92 
 
 
553 aa  340  5e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  38.62 
 
 
535 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1554  protein of unknown function DUF894 DitE  39.89 
 
 
553 aa  335  9e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2884  hypothetical protein  41.78 
 
 
543 aa  335  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  40.04 
 
 
532 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5161  protein of unknown function DUF894, DitE  38.55 
 
 
532 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0839068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  39.25 
 
 
549 aa  324  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  39.44 
 
 
560 aa  324  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  36.89 
 
 
542 aa  319  7e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1272  protein of unknown function DUF894 DitE  38.92 
 
 
551 aa  318  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.951526 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  38.16 
 
 
541 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5315  putative major facilitator superfamily transporter  36.85 
 
 
539 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00425912  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5468  protein of unknown function DUF894 DitE  39.2 
 
 
535 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0189  hypothetical protein  38.23 
 
 
539 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4414  protein of unknown function DUF894, DitE  39.34 
 
 
557 aa  306  6e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.91404 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0311  transporter, putative  37.42 
 
 
542 aa  301  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.054545  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3437  protein of unknown function DUF894 DitE  36.59 
 
 
551 aa  301  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545505  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2389  protein of unknown function DUF894 DitE  38.26 
 
 
549 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0287  putative transporter  37.22 
 
 
542 aa  298  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0736  protein of unknown function DUF894, DitE  38.06 
 
 
539 aa  297  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2303  protein of unknown function DUF894 DitE  36.89 
 
 
536 aa  295  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  36.56 
 
 
586 aa  290  7e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3361  protein of unknown function DUF894 DitE  36.84 
 
 
542 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4167  protein of unknown function DUF894, DitE  36.95 
 
 
532 aa  288  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1578  MFS family transporter  40.77 
 
 
529 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0176553  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0637  protein of unknown function DUF894, DitE  37.07 
 
 
536 aa  286  5e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167725  normal  0.197731 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2332  protein of unknown function DUF894 DitE  37.26 
 
 
549 aa  283  4.0000000000000003e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0975452  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4071  protein of unknown function DUF894 DitE  37.35 
 
 
543 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0009  protein of unknown function DUF894, DitE  36.8 
 
 
527 aa  281  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0118  hypothetical protein  38.4 
 
 
562 aa  279  9e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19310  hypothetical protein  33.01 
 
 
571 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1662  hypothetical protein  33.01 
 
 
572 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0685  protein of unknown function DUF894, DitE  37.04 
 
 
562 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.667795 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0803  protein of unknown function DUF894, DitE  37.28 
 
 
544 aa  271  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288414  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4092  protein of unknown function DUF894, DitE  36.88 
 
 
519 aa  270  7e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146023  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5125  protein of unknown function DUF894 DitE  36.67 
 
 
542 aa  267  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3362  protein of unknown function DUF894 DitE  37.48 
 
 
569 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4012  protein of unknown function DUF894, DitE  37.48 
 
 
569 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2969  protein of unknown function DUF894, DitE  41.21 
 
 
561 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.207712 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2604  protein of unknown function DUF894, DitE  40.81 
 
 
541 aa  260  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0945  major facilitator transporter  40.81 
 
 
541 aa  259  7e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4649  protein of unknown function DUF894, DitE  38.52 
 
 
574 aa  256  8e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0090  protein of unknown function DUF894 DitE  37.5 
 
 
562 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0278  major facilitator superfamily permease  35.07 
 
 
560 aa  242  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2025  protein of unknown function DUF894, DitE  32.55 
 
 
554 aa  236  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0448  protein of unknown function DUF894, DitE  34.33 
 
 
555 aa  236  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  38.3 
 
 
419 aa  235  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3253  protein of unknown function DUF894, DitE  35.77 
 
 
533 aa  229  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373  normal  0.254586 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1954  hypothetical protein  37.68 
 
 
433 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  37.29 
 
 
409 aa  212  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1414  hypothetical protein  37.07 
 
 
433 aa  200  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322764  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3174  hypothetical protein  37.07 
 
 
433 aa  200  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.932461  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2139  hypothetical protein  37.07 
 
 
433 aa  200  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1637  hypothetical protein  37.07 
 
 
429 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558918  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2524  major facilitator family transporter  37.07 
 
 
433 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2666  MFS permease  36.83 
 
 
433 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2578  major facilitator family transporter  36.83 
 
 
433 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.909928  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 
433 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 
421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  33.33 
 
 
431 aa  173  7.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  30.73 
 
 
429 aa  167  4e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 
442 aa  167  5.9999999999999996e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  34.08 
 
 
418 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  30.16 
 
 
436 aa  160  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 
440 aa  158  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  28.43 
 
 
430 aa  156  7e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  29.85 
 
 
410 aa  157  7e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 
461 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  29.61 
 
 
412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 
453 aa  147  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 
412 aa  147  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  32.13 
 
 
474 aa  147  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  32.25 
 
 
450 aa  145  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 
450 aa  144  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  34.16 
 
 
441 aa  144  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  32.56 
 
 
424 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  29.34 
 
 
418 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  31.96 
 
 
405 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 
417 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  29.78 
 
 
474 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 
415 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  30.99 
 
 
414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  31.74 
 
 
415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  32.36 
 
 
413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  30.25 
 
 
457 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 
456 aa  134  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 
418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  29.61 
 
 
426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>