More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0311 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0311  transporter, putative  100 
 
 		 542 aa  1086    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.054545  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4071  protein of unknown function DUF894 DitE  63.59 
 
 		 543 aa  638    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3361  protein of unknown function DUF894 DitE  89.85 
 
 		 542 aa  943    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0287  putative transporter  99.82 
 
 		 542 aa  1083    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3437  protein of unknown function DUF894 DitE  66.67 
 
 		 551 aa  697    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  71.72 
 
 		 541 aa  761    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  61.3 
 
 		 542 aa  675    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2969  protein of unknown function DUF894, DitE  67.66 
 
 		 561 aa  618  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.207712 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0945  major facilitator transporter  67.16 
 
 		 541 aa  616  1e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2604  protein of unknown function DUF894, DitE  67.16 
 
 		 541 aa  616  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0803  protein of unknown function DUF894, DitE  60.37 
 
 		 544 aa  594  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4414  protein of unknown function DUF894, DitE  54.3 
 
 		 557 aa  508  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.91404 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0685  protein of unknown function DUF894, DitE  44.89 
 
 		 562 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.667795 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0118  hypothetical protein  43.18 
 
 		 562 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0278  major facilitator superfamily permease  45 
 
 		 560 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0448  protein of unknown function DUF894, DitE  41.57 
 
 		 555 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3253  protein of unknown function DUF894, DitE  48.74 
 
 		 533 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373  normal  0.254586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0090  protein of unknown function DUF894 DitE  42.94 
 
 		 562 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1272  protein of unknown function DUF894 DitE  40.47 
 
 		 551 aa  351  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.951526 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2025  protein of unknown function DUF894, DitE  37.21 
 
 		 554 aa  345  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1662  hypothetical protein  36.79 
 
 		 572 aa  337  5e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19310  hypothetical protein  36.67 
 
 		 571 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1554  protein of unknown function DUF894 DitE  40.19 
 
 		 553 aa  332  9e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  37.67 
 
 		 532 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  38.64 
 
 		 560 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  37.5 
 
 		 535 aa  325  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  39.03 
 
 		 549 aa  325  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2332  protein of unknown function DUF894 DitE  40.3 
 
 		 549 aa  323  4e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0975452  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  37.75 
 
 		 532 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2884  hypothetical protein  36.92 
 
 		 543 aa  320  5e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  42.93 
 
 		 419 aa  319  9e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  37.4 
 
 		 553 aa  312  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5468  protein of unknown function DUF894 DitE  38.8 
 
 		 535 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5315  putative major facilitator superfamily transporter  39.05 
 
 		 539 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00425912  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  37.35 
 
 		 526 aa  310  5e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29210  putative MFS transporter  39.76 
 
 		 529 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2389  protein of unknown function DUF894 DitE  37.69 
 
 		 549 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5161  protein of unknown function DUF894, DitE  37.55 
 
 		 532 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0839068 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42320  major facilitator transpoter  38.96 
 
 		 535 aa  298  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.956299  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3978  transmembrane transport protein  39.36 
 
 		 528 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2665  protein of unknown function DUF894, DitE  35.15 
 
 		 542 aa  297  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0627895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0189  hypothetical protein  36.94 
 
 		 539 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  36.42 
 
 		 530 aa  295  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  34.04 
 
 		 586 aa  293  6e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0736  protein of unknown function DUF894, DitE  36.83 
 
 		 539 aa  293  7e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1167  protein of unknown function DUF894, DitE  36.61 
 
 		 529 aa  292  8e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1578  MFS family transporter  38.68 
 
 		 529 aa  290  3e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0176553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0215  protein of unknown function DUF894, DitE  37.63 
 
 		 533 aa  280  6e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.155573  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0225  protein of unknown function DUF894, DitE  37.42 
 
 		 533 aa  279  8e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.383838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0235  protein of unknown function DUF894, DitE  37.42 
 
 		 533 aa  279  8e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2303  protein of unknown function DUF894 DitE  35.35 
 
 		 536 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0637  protein of unknown function DUF894, DitE  34.61 
 
 		 536 aa  271  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167725  normal  0.197731 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  42.58 
 
 		 409 aa  263  4.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4092  protein of unknown function DUF894, DitE  35.31 
 
 		 519 aa  260  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4012  protein of unknown function DUF894, DitE  35 
 
 		 569 aa  258  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3362  protein of unknown function DUF894 DitE  35 
 
 		 569 aa  258  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1954  hypothetical protein  39.05 
 
 		 433 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0009  protein of unknown function DUF894, DitE  30.5 
 
 		 527 aa  253  9.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3144  MFS family transporter  35.08 
 
 		 541 aa  250  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.631195  normal  0.502456 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5125  protein of unknown function DUF894 DitE  33.27 
 
 		 542 aa  248  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2666  MFS permease  39.61 
 
 		 433 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2578  major facilitator family transporter  39.61 
 
 		 433 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.909928  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1414  hypothetical protein  39.36 
 
 		 433 aa  246  9e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322764  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2139  hypothetical protein  39.36 
 
 		 433 aa  246  9e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3174  hypothetical protein  39.36 
 
 		 433 aa  246  9e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.932461  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1637  hypothetical protein  39.36 
 
 		 429 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558918  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2524  major facilitator family transporter  39.36 
 
 		 433 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4649  protein of unknown function DUF894, DitE  33.97 
 
 		 574 aa  243  5e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4167  protein of unknown function DUF894, DitE  30.49 
 
 		 532 aa  227  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 		 461 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 450 aa  155  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  27.98 
 
 		 430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  32.17 
 
 		 452 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 418 aa  147  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 474 aa  146  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 418 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 413 aa  146  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 410 aa  145  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  28.57 
 
 		 418 aa  144  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  26.99 
 
 		 410 aa  144  5e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  29.47 
 
 		 431 aa  144  6e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 453 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  28.75 
 
 		 429 aa  141  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 442 aa  141  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 		 404 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 474 aa  139  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  26.3 
 
 		 424 aa  139  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 450 aa  139  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 440 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.97 
 
 		 446 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  29.97 
 
 		 413 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 446 aa  136  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 442 aa  136  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  29.2 
 
 		 441 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>