More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0685 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0118  hypothetical protein  91.1 
 
 		 562 aa  966    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0278  major facilitator superfamily permease  75.6 
 
 		 560 aa  734    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0685  protein of unknown function DUF894, DitE  100 
 
 		 562 aa  1100    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.667795 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0090  protein of unknown function DUF894 DitE  85.94 
 
 		 562 aa  872    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0448  protein of unknown function DUF894, DitE  54.36 
 
 		 555 aa  555  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2025  protein of unknown function DUF894, DitE  50.27 
 
 		 554 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4414  protein of unknown function DUF894, DitE  48.29 
 
 		 557 aa  437  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.91404 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0311  transporter, putative  44.89 
 
 		 542 aa  434  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.054545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0287  putative transporter  44.7 
 
 		 542 aa  431  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3437  protein of unknown function DUF894 DitE  46.71 
 
 		 551 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  44.34 
 
 		 541 aa  429  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  45.37 
 
 		 542 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3361  protein of unknown function DUF894 DitE  45.3 
 
 		 542 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4071  protein of unknown function DUF894 DitE  47.68 
 
 		 543 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2604  protein of unknown function DUF894, DitE  45.2 
 
 		 541 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0945  major facilitator transporter  45.2 
 
 		 541 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0803  protein of unknown function DUF894, DitE  43.56 
 
 		 544 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2969  protein of unknown function DUF894, DitE  44.44 
 
 		 561 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.207712 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  39.42 
 
 		 526 aa  325  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  35.88 
 
 		 532 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  35.05 
 
 		 586 aa  303  8.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19310  hypothetical protein  32 
 
 		 571 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1662  hypothetical protein  32.13 
 
 		 572 aa  294  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1272  protein of unknown function DUF894 DitE  36.03 
 
 		 551 aa  293  5e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.951526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2884  hypothetical protein  37.12 
 
 		 543 aa  292  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  34.93 
 
 		 535 aa  291  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  34.44 
 
 		 553 aa  290  4e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  35.5 
 
 		 560 aa  288  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1554  protein of unknown function DUF894 DitE  35.92 
 
 		 553 aa  288  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  38.37 
 
 		 530 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  45.58 
 
 		 419 aa  285  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3253  protein of unknown function DUF894, DitE  41 
 
 		 533 aa  285  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373  normal  0.254586 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  33.9 
 
 		 532 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5315  putative major facilitator superfamily transporter  35.98 
 
 		 539 aa  282  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00425912  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5468  protein of unknown function DUF894 DitE  35.92 
 
 		 535 aa  280  7e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0009  protein of unknown function DUF894, DitE  34.58 
 
 		 527 aa  275  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2303  protein of unknown function DUF894 DitE  36.49 
 
 		 536 aa  273  7e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0736  protein of unknown function DUF894, DitE  34.3 
 
 		 539 aa  271  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2332  protein of unknown function DUF894 DitE  35.31 
 
 		 549 aa  270  5.9999999999999995e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0975452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42320  major facilitator transpoter  36.75 
 
 		 535 aa  268  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.956299  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1167  protein of unknown function DUF894, DitE  37.08 
 
 		 529 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5161  protein of unknown function DUF894, DitE  33.9 
 
 		 532 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0839068 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0637  protein of unknown function DUF894, DitE  34.7 
 
 		 536 aa  265  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167725  normal  0.197731 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3362  protein of unknown function DUF894 DitE  36.12 
 
 		 569 aa  264  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4012  protein of unknown function DUF894, DitE  36.12 
 
 		 569 aa  264  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29210  putative MFS transporter  35.01 
 
 		 529 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4167  protein of unknown function DUF894, DitE  33.86 
 
 		 532 aa  261  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5125  protein of unknown function DUF894 DitE  36.1 
 
 		 542 aa  260  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1578  MFS family transporter  38.04 
 
 		 529 aa  258  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0176553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4092  protein of unknown function DUF894, DitE  33.91 
 
 		 519 aa  258  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  34.71 
 
 		 549 aa  258  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3978  transmembrane transport protein  34.1 
 
 		 528 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2665  protein of unknown function DUF894, DitE  34.49 
 
 		 542 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0627895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3144  MFS family transporter  36.73 
 
 		 541 aa  253  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.631195  normal  0.502456 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0215  protein of unknown function DUF894, DitE  37.57 
 
 		 533 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.155573  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0225  protein of unknown function DUF894, DitE  37.57 
 
 		 533 aa  250  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.383838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0235  protein of unknown function DUF894, DitE  37.57 
 
 		 533 aa  250  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4649  protein of unknown function DUF894, DitE  34.3 
 
 		 574 aa  246  6e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0189  hypothetical protein  34.04 
 
 		 539 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2389  protein of unknown function DUF894 DitE  34.22 
 
 		 549 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  42.58 
 
 		 409 aa  242  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1954  hypothetical protein  41.15 
 
 		 433 aa  240  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3174  hypothetical protein  41.62 
 
 		 433 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.932461  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1414  hypothetical protein  41.62 
 
 		 433 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322764  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2139  hypothetical protein  41.62 
 
 		 433 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1637  hypothetical protein  41.62 
 
 		 429 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558918  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2524  major facilitator family transporter  41.62 
 
 		 433 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2578  major facilitator family transporter  41.37 
 
 		 433 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.909928  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2666  MFS permease  41.37 
 
 		 433 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 440 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 436 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 442 aa  134  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  27.44 
 
 		 431 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 417 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 415 aa  126  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 421 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  31.83 
 
 		 441 aa  124  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 474 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  24.33 
 
 		 410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 407 aa  120  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  24.41 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 457 aa  117  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 		 406 aa  117  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 402 aa  115  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 433 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 412 aa  114  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 412 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 405 aa  113  9e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 431 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  30.03 
 
 		 418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  29.87 
 
 		 446 aa  112  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 450 aa  111  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 423 aa  111  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 447 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 408 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 441 aa  110  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  29.37 
 
 		 426 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>