More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3596 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 417 aa  812    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3542  major facilitator superfamily MFS_1  48.99 
 
 		 405 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00114528  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  39.57 
 
 		 412 aa  232  8.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  35.66 
 
 		 433 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  35.34 
 
 		 474 aa  219  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  37.09 
 
 		 442 aa  217  2e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  36.77 
 
 		 431 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 436 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  36.57 
 
 		 440 aa  208  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  34.99 
 
 		 430 aa  208  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 474 aa  206  9e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  36.39 
 
 		 431 aa  204  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  35.85 
 
 		 418 aa  202  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 412 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  32.66 
 
 		 429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  35.61 
 
 		 415 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  33.86 
 
 		 418 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 		 378 aa  192  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  37.81 
 
 		 404 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 426 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  32.65 
 
 		 424 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 		 419 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  34.2 
 
 		 446 aa  189  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  34.19 
 
 		 440 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 433 aa  187  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  39.34 
 
 		 417 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 441 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 		 418 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 413 aa  176  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  32.58 
 
 		 426 aa  175  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  35.44 
 
 		 413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 413 aa  171  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 409 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  34.22 
 
 		 456 aa  168  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 421 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  31.3 
 
 		 410 aa  167  2e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 457 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  35.18 
 
 		 413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 450 aa  167  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  34.09 
 
 		 435 aa  166  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 426 aa  166  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  32.64 
 
 		 423 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 413 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 413 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 416 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  33.85 
 
 		 402 aa  164  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 		 442 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  35.46 
 
 		 414 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 413 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  35.46 
 
 		 412 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  34.19 
 
 		 421 aa  160  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 418 aa  160  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  34.42 
 
 		 404 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  34.61 
 
 		 416 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  28.46 
 
 		 403 aa  159  9e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0420  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 414 aa  158  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  36.08 
 
 		 419 aa  159  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 476 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  29.46 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 407 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 450 aa  157  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.03 
 
 		 446 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 414 aa  156  8e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  33.73 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  33.09 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0297  major facilitator superfamily MFS_1  37.01 
 
 		 423 aa  155  1e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0210722  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  32.93 
 
 		 405 aa  153  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  34.19 
 
 		 446 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 		 441 aa  152  8.999999999999999e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  34.75 
 
 		 494 aa  152  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  32.84 
 
 		 424 aa  151  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 		 410 aa  151  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1008  major facilitator superfamily MFS_1  36.56 
 
 		 414 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  35.6 
 
 		 461 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  32.99 
 
 		 452 aa  149  9e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  34.51 
 
 		 424 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1011  major facilitator superfamily MFS_1  36.56 
 
 		 414 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 		 436 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 432 aa  145  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  32.27 
 
 		 425 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 414 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>