More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3035 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  99.06 
 
 		 425 aa  814    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  100 
 
 		 425 aa  822    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  57.61 
 
 		 410 aa  438  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  37.63 
 
 		 446 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 447 aa  233  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  35.09 
 
 		 474 aa  232  9e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 441 aa  216  7e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 		 421 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  35.09 
 
 		 424 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  34.45 
 
 		 440 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  38.34 
 
 		 426 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  34.11 
 
 		 401 aa  196  6e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  35.79 
 
 		 412 aa  196  8.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 419 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 414 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 		 413 aa  189  5.999999999999999e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  34.01 
 
 		 431 aa  186  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 413 aa  186  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  36.63 
 
 		 414 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 450 aa  184  4.0000000000000006e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 		 440 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 409 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  29.25 
 
 		 430 aa  183  7e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  31.96 
 
 		 435 aa  182  9.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  34.32 
 
 		 418 aa  182  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 442 aa  182  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  27 
 
 		 413 aa  179  9e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 418 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  36.23 
 
 		 426 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 461 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 436 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  32.65 
 
 		 414 aa  172  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 428 aa  170  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 421 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  29.43 
 
 		 431 aa  169  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  32.61 
 
 		 426 aa  169  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 		 410 aa  170  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1008  major facilitator superfamily MFS_1  36.63 
 
 		 414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 		 408 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 		 424 aa  166  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 474 aa  166  8e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1011  major facilitator superfamily MFS_1  36.63 
 
 		 414 aa  166  8e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  30.62 
 
 		 423 aa  166  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  30.46 
 
 		 429 aa  164  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 		 415 aa  163  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 		 441 aa  162  9e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 413 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 417 aa  160  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 450 aa  160  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  32.34 
 
 		 456 aa  158  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 		 494 aa  157  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  31.57 
 
 		 431 aa  156  6e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 431 aa  155  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 		 432 aa  152  8e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 412 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 416 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 435 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 413 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 413 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 457 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 413 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  32.07 
 
 		 452 aa  150  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  32.62 
 
 		 441 aa  149  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  31.54 
 
 		 413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 509 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  31.04 
 
 		 433 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3542  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00114528  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  32.45 
 
 		 412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 		 418 aa  147  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 404 aa  146  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 446 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 		 417 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 441 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.85 
 
 		 446 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  26.09 
 
 		 403 aa  144  3e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 		 428 aa  143  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 453 aa  143  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  31.55 
 
 		 424 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 426 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5797  hypothetical protein  30.92 
 
 		 419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 		 452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 416 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 419 aa  140  4.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  31.9 
 
 		 560 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5471  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 412 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6034  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0822285  normal  0.0406983 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4879  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5391  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 412 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.667839  normal  0.033436 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  32 
 
 		 535 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1554  protein of unknown function DUF894 DitE  30.99 
 
 		 553 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>