More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0875 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 441 aa  865    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  64.88 
 
 		 450 aa  578  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  74.25 
 
 		 456 aa  580  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  67.48 
 
 		 452 aa  555  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  65.62 
 
 		 426 aa  495  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  62.84 
 
 		 432 aa  484  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  52.22 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  50 
 
 		 450 aa  418  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  47.42 
 
 		 446 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 457 aa  405  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  47.49 
 
 		 446 aa  388  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  54.42 
 
 		 418 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  48.07 
 
 		 419 aa  379  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  50.51 
 
 		 413 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  50.4 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  50.25 
 
 		 413 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  50.25 
 
 		 413 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  51.41 
 
 		 418 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  49.15 
 
 		 419 aa  362  7.0000000000000005e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  48.1 
 
 		 441 aa  362  8e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  49.37 
 
 		 412 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  49.21 
 
 		 405 aa  361  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  48.16 
 
 		 416 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  48.05 
 
 		 420 aa  354  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  51.25 
 
 		 461 aa  354  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  48.3 
 
 		 413 aa  351  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  49.33 
 
 		 416 aa  348  7e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  48.19 
 
 		 404 aa  348  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  48.77 
 
 		 476 aa  347  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  47.8 
 
 		 424 aa  346  5e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  47.62 
 
 		 414 aa  343  2.9999999999999997e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  50.81 
 
 		 428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  48.38 
 
 		 424 aa  333  3e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  48 
 
 		 403 aa  333  4e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  43.6 
 
 		 425 aa  330  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  49.32 
 
 		 442 aa  319  5e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  40.46 
 
 		 406 aa  318  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  48.18 
 
 		 452 aa  317  3e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  49.87 
 
 		 405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  43.71 
 
 		 426 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  41.15 
 
 		 412 aa  301  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  44.41 
 
 		 429 aa  297  3e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  43.23 
 
 		 426 aa  296  5e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  42.16 
 
 		 441 aa  293  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  44.41 
 
 		 431 aa  291  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  43.57 
 
 		 453 aa  279  8e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  41.51 
 
 		 417 aa  276  4e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  43.85 
 
 		 509 aa  276  6e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  39.62 
 
 		 494 aa  268  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  45.14 
 
 		 412 aa  267  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  39.61 
 
 		 435 aa  259  6e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  40.93 
 
 		 431 aa  258  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  39.19 
 
 		 436 aa  256  5e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3670  major facilitator superfamily MFS_1  40.59 
 
 		 475 aa  254  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  38.92 
 
 		 426 aa  245  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  40.38 
 
 		 429 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  36.59 
 
 		 430 aa  241  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  40.22 
 
 		 491 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  35.37 
 
 		 421 aa  234  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 418 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  39.3 
 
 		 418 aa  231  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  34.5 
 
 		 412 aa  226  6e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 		 442 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  37.06 
 
 		 441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 474 aa  216  7e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  34.79 
 
 		 433 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 		 418 aa  212  9e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  35.41 
 
 		 446 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  39.72 
 
 		 404 aa  208  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 410 aa  206  6e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  35.18 
 
 		 474 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 440 aa  204  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  34.09 
 
 		 428 aa  204  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 440 aa  204  4e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  37.4 
 
 		 412 aa  203  6e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 413 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 447 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  38.02 
 
 		 421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  34.53 
 
 		 378 aa  194  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3120  major facilitator superfamily MFS_1  38.92 
 
 		 428 aa  193  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  28.71 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 409 aa  190  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  32 
 
 		 410 aa  190  4e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  33.07 
 
 		 429 aa  188  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 410 aa  188  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 		 417 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  32.19 
 
 		 431 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  34.49 
 
 		 426 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  37.95 
 
 		 414 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  31.35 
 
 		 424 aa  180  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 413 aa  179  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 423 aa  176  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 401 aa  176  9e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0297  major facilitator superfamily MFS_1  35.2 
 
 		 423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0210722  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 414 aa  172  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>