More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1325 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
419 aa  812    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  72.84 
 
 
446 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  69.95 
 
 
446 aa  579  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  69.95 
 
 
441 aa  549  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  68.51 
 
 
418 aa  508  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  65.84 
 
 
404 aa  510  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  72.26 
 
 
428 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  64.2 
 
 
413 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  63.95 
 
 
413 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  66.25 
 
 
416 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  63.95 
 
 
413 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  65.1 
 
 
405 aa  497  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  63.95 
 
 
412 aa  482  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  65.09 
 
 
402 aa  482  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  67.11 
 
 
416 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  48.8 
 
 
450 aa  395  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  49.51 
 
 
412 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  52.42 
 
 
456 aa  385  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  49 
 
 
406 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  49.15 
 
 
441 aa  375  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  52.61 
 
 
450 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  51.97 
 
 
452 aa  363  3e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  50.12 
 
 
428 aa  360  3e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  50.79 
 
 
424 aa  348  7e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  49.35 
 
 
457 aa  347  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  50.62 
 
 
461 aa  342  8e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  52.02 
 
 
418 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  49.01 
 
 
426 aa  338  9.999999999999999e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
419 aa  336  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  46.9 
 
 
432 aa  330  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  47.49 
 
 
420 aa  322  9.000000000000001e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  46.52 
 
 
414 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  46.17 
 
 
413 aa  309  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  45.67 
 
 
424 aa  308  9e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  47.39 
 
 
476 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
442 aa  299  5e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  45.91 
 
 
403 aa  290  4e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  47.87 
 
 
405 aa  290  4e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  44.56 
 
 
429 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  43.78 
 
 
417 aa  271  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  46.79 
 
 
452 aa  271  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  43.68 
 
 
426 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  42.44 
 
 
453 aa  265  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 
425 aa  262  8e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  42.31 
 
 
426 aa  260  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  42.6 
 
 
441 aa  260  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  44.69 
 
 
450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  43.09 
 
 
435 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  40.97 
 
 
436 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  40.32 
 
 
431 aa  253  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  38.34 
 
 
509 aa  244  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  42.56 
 
 
412 aa  238  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3670  major facilitator superfamily MFS_1  39.68 
 
 
475 aa  235  8e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  43.6 
 
 
491 aa  232  9e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  38.92 
 
 
431 aa  230  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  40.05 
 
 
418 aa  229  6e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  37.98 
 
 
494 aa  226  6e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  39.62 
 
 
426 aa  226  8e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  37.23 
 
 
412 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  35.7 
 
 
430 aa  215  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  38.92 
 
 
429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  33.99 
 
 
409 aa  209  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  37.41 
 
 
446 aa  206  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  38.5 
 
 
412 aa  205  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  38.86 
 
 
413 aa  203  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  35.64 
 
 
474 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 
421 aa  200  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  35.48 
 
 
447 aa  200  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 
410 aa  199  7e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  37.32 
 
 
441 aa  199  7.999999999999999e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  33.42 
 
 
410 aa  197  3e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
423 aa  193  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  38.52 
 
 
474 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  32.88 
 
 
418 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 
418 aa  190  5e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 
419 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  33.16 
 
 
403 aa  186  5e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3120  major facilitator superfamily MFS_1  39.46 
 
 
428 aa  186  8e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
440 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  37.16 
 
 
440 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  33.73 
 
 
436 aa  183  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  38.37 
 
 
413 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  34.22 
 
 
424 aa  180  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 
442 aa  178  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 
433 aa  179  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  33.25 
 
 
424 aa  176  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  35.79 
 
 
415 aa  176  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  33.25 
 
 
428 aa  176  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  34.83 
 
 
378 aa  175  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3320  major facilitator transporter  41.39 
 
 
425 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104451  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  33.99 
 
 
431 aa  172  9e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 
404 aa  172  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  35.4 
 
 
426 aa  169  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  35.12 
 
 
401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  31.7 
 
 
432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 
414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  29.93 
 
 
413 aa  162  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 
417 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  35.48 
 
 
414 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 
453 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>