More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0490 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 461 aa  887    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  70.56 
 
 		 424 aa  542  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  63.85 
 
 		 414 aa  476  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  61.76 
 
 		 418 aa  412  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  54.36 
 
 		 413 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  55.05 
 
 		 424 aa  398  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  55.64 
 
 		 403 aa  391  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  53 
 
 		 456 aa  386  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  49.66 
 
 		 446 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  50.86 
 
 		 457 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  51.25 
 
 		 441 aa  369  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  48.51 
 
 		 446 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  50.61 
 
 		 420 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  49.25 
 
 		 450 aa  368  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  48.97 
 
 		 405 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  52.61 
 
 		 476 aa  363  3e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  52.62 
 
 		 452 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  48.4 
 
 		 413 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  48.4 
 
 		 413 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  49.39 
 
 		 416 aa  349  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  48.4 
 
 		 413 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  50.38 
 
 		 418 aa  345  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  50.79 
 
 		 419 aa  345  1e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  50.37 
 
 		 442 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  48.31 
 
 		 402 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  48.61 
 
 		 404 aa  343  4e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  50.13 
 
 		 412 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  54.26 
 
 		 452 aa  339  5e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  51.49 
 
 		 405 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  50.53 
 
 		 416 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  47.13 
 
 		 441 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  45.81 
 
 		 425 aa  336  5.999999999999999e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  48.48 
 
 		 441 aa  331  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  47.58 
 
 		 419 aa  328  8e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  46.77 
 
 		 432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  50.13 
 
 		 428 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  50.13 
 
 		 428 aa  325  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  46.85 
 
 		 450 aa  325  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  46.5 
 
 		 426 aa  322  6e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  49.6 
 
 		 426 aa  319  6e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  46.73 
 
 		 426 aa  316  6e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  45.91 
 
 		 436 aa  315  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  48.92 
 
 		 417 aa  311  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  47.62 
 
 		 450 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  47.63 
 
 		 429 aa  306  6e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  38.83 
 
 		 406 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  49.22 
 
 		 412 aa  298  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  45.48 
 
 		 435 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  40.8 
 
 		 494 aa  292  9e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  40.72 
 
 		 509 aa  290  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  43.58 
 
 		 431 aa  286  5.999999999999999e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  45.93 
 
 		 418 aa  279  7e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  47.72 
 
 		 491 aa  276  5e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  43.52 
 
 		 453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3670  major facilitator superfamily MFS_1  41.89 
 
 		 475 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  39.65 
 
 		 421 aa  272  9e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  39.87 
 
 		 474 aa  259  9e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 412 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  37.34 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  37.1 
 
 		 418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  41.18 
 
 		 431 aa  250  4e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  36.43 
 
 		 430 aa  238  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  36.64 
 
 		 433 aa  239  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  41.75 
 
 		 412 aa  238  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  36.11 
 
 		 426 aa  236  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  37.32 
 
 		 442 aa  232  9e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  36.83 
 
 		 436 aa  230  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 426 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 		 440 aa  227  4e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  40 
 
 		 429 aa  224  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  40 
 
 		 413 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  34.43 
 
 		 410 aa  218  1e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3120  major facilitator superfamily MFS_1  39.86 
 
 		 428 aa  216  7e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 		 410 aa  216  9e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  36.76 
 
 		 428 aa  213  7.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 417 aa  212  9e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 418 aa  212  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  38.7 
 
 		 421 aa  212  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 474 aa  211  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  34.84 
 
 		 431 aa  209  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  36.28 
 
 		 447 aa  208  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  38.18 
 
 		 426 aa  206  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  32.49 
 
 		 403 aa  205  1e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  39.58 
 
 		 441 aa  205  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  35.42 
 
 		 446 aa  204  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  39.12 
 
 		 440 aa  202  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 413 aa  200  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  34.76 
 
 		 413 aa  199  9e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  35.25 
 
 		 429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  34.52 
 
 		 410 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  39.43 
 
 		 378 aa  197  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3320  major facilitator transporter  41.29 
 
 		 425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104451  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 		 409 aa  193  7e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 423 aa  190  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  38.96 
 
 		 404 aa  190  5e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 		 415 aa  189  8e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  35.78 
 
 		 453 aa  189  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  35.9 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  31.58 
 
 		 424 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  35.7 
 
 		 424 aa  182  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>