More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_2010 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  100 
 
 		 429 aa  855    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  66.98 
 
 		 433 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  67.08 
 
 		 431 aa  523  1e-147  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  52.53 
 
 		 436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  53.57 
 
 		 442 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  52.53 
 
 		 440 aa  443  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  44.28 
 
 		 430 aa  363  4e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  38.3 
 
 		 412 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  36.01 
 
 		 424 aa  242  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  37.03 
 
 		 418 aa  237  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 		 431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  35.12 
 
 		 428 aa  232  9e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  37.33 
 
 		 446 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 474 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 		 453 aa  227  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 419 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 418 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  33.84 
 
 		 447 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 		 432 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  36.19 
 
 		 408 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  36.12 
 
 		 440 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 426 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  37.18 
 
 		 378 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  35.5 
 
 		 450 aa  216  7e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  37.17 
 
 		 474 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 		 433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 		 415 aa  214  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  35.2 
 
 		 441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 		 421 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  36.07 
 
 		 417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  37.33 
 
 		 404 aa  209  6e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 418 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  37.74 
 
 		 418 aa  207  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 		 401 aa  204  3e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 		 461 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  34.4 
 
 		 450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  35.58 
 
 		 414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 		 421 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  36.27 
 
 		 476 aa  200  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 441 aa  199  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 413 aa  199  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  35.23 
 
 		 426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 414 aa  196  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  29.51 
 
 		 435 aa  196  6e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  33.25 
 
 		 413 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 413 aa  196  8.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 456 aa  193  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 423 aa  194  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3542  major facilitator superfamily MFS_1  34.63 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00114528  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  32.73 
 
 		 414 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  33.92 
 
 		 424 aa  189  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  33.67 
 
 		 413 aa  187  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  32.59 
 
 		 405 aa  186  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  33.07 
 
 		 410 aa  186  5e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 417 aa  184  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  33.59 
 
 		 452 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 410 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 432 aa  182  8.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2884  hypothetical protein  34.42 
 
 		 543 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  31.31 
 
 		 403 aa  182  1e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 491 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 429 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  32.64 
 
 		 424 aa  179  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  32.36 
 
 		 423 aa  179  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 413 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 413 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 450 aa  178  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 412 aa  178  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 413 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 		 435 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.37 
 
 		 446 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 		 419 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  31.56 
 
 		 414 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 441 aa  172  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  30.08 
 
 		 426 aa  171  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 		 446 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  31.7 
 
 		 442 aa  169  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  32.68 
 
 		 526 aa  169  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1008  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 414 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  34.11 
 
 		 426 aa  168  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1011  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 425 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  31.52 
 
 		 425 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 405 aa  166  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 407 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 416 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 431 aa  162  8.000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  30.98 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  31.57 
 
 		 453 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>